一、为海军而战
在接受日本投降后，尼米兹上将在离开弗雷德里斯克堡回到珍珠港。这里有许多工作要处理--完成各种总结报告，停靠舰队舰只，安排两百多万军人回国，人们称此为"皮毯行动"。正如尼米兹向那些心急如焚的亲属们所解释的那样，将人员从太平洋复员回国比从大西洋复员需要更多的时间。他再次请求人们耐心等待。
几天时间里，尼米兹、金和福雷斯特尔发表了一些声明，号召维持一支"世界上前所未有的最强大的海上武力"。这时候的美国海军正处于历史上的鼎盛期，二战期间建造的舰只数目超过以往任何时候。然而，随着和平的来临，要求陆、海军进行裁减的呼声日益强烈。一些美国人听信了这样一种宣传，认为是原子弹赢得了这场战争，因而把能够运载原子弹进行远程轰炸的空军看做是国家的首要防御力量。他们认为投放原子弹将是未来战争中迅速取胜的捷径，而强大的舰队似乎不再是必不可少的了。
曾经指挥过空军轰炸德国的卡尔·A·斯帕茨将军说："为什么我们还要继续保留海军？我们保留海军的惟一理由也许是某些国家还保留着海军。而苏联只有一支小海军，或者说简直没有什么海军。我们确实不需要把钱浪费在海军身上了！"
尼米兹认为，取消美国拥有的庞大舰队是违背美国人根本利益的，他指出："这种取消海军舰队的论调并不新鲜，在潜艇出现时，在鱼雷出现时，在飞机出现时，都曾经叫嚷过。结果，这些认为海军末日已来临的"预言家"们只是徒然喊哑了嗓子。正确的态度应该是使海军建设适应新式武器的发展。具有海军传统的聪明的美国人是决不会听任海军衰亡的！"
然而，华盛顿的态度与尼米兹的看法并不一致。他获悉杜鲁门总统根本没有在"密苏里"号去纽约的航程中使用它，而是坚持要使用一艘不知名的驱逐舰。他在纽约中央公园匆忙搭起来的一个讲台上做了演讲，尽管是在"海军节"这一天演讲，杜鲁门的演讲中却含有对海军的不满成分，如果认真听的话，在全篇中部可听出来。总统大部分时间谈到欧洲战场的胜利，始终不断地表扬陆军乔治·马歇尔上将。他结束讲话时表示希望他能劝说海军与陆军进行合作。
总统通篇演讲的态度都是偏向于陆军，而海军则好像是后娘养的。尼米兹收到讲稿，看出了其中的奥妙，海军在杜鲁门心中未占优先地位--这使得尼米兹更觉得有理由争取任职海军作战部长。
然而，另一个问题使这事难于决定。在过去两年的作战中，尼米兹已获得了军种统一指挥的某种模式，一年多前，他曾建议做全军性的推广。他赞成设立一名武装部队的司令以充分的权力和责任统帅各军兵种，虽然他认为在他活着的时候这种想法不会实现，但是在不远的将来总是可以实现的。尼米兹一而再，再而三地强调太平洋战争的胜利是由于各军兵种的合作精神。
这种想法目前可能与自己所处的形势大相径庭，既然尼米兹当时已改变了这种想法，这事也就不宜再提了。一年多前，这种军兵种联合的主张似乎行之有效。在当时考虑由谁来承当战略决策任务时，麦克阿瑟赫然出现于前，他竟然要让陆军进行组织和指挥战略行动，这就损害了武装部队的其他军兵种。
麦克阿瑟根本不理解尼米兹横越中太平洋出击的作战方案，尼米兹当然明白采取此项行动的原因，这一作战行动只能由舰艇和飞机实施，步行的陆军不包括在内。因此，尼米兹认为，其一个人不会拥有此种权力，也许一个与任何军种无直接关系的人将能更适于、并能更为公正地担任直接指挥的任务。但是此时，麦克阿瑟由于被委任为进攻日本的总司令，又是接受日本投降的主持人，又是驻日占领军司令，众望所归，因而尼米兹认识到，他应付出全部努力以保护海军的独立与地位。从道义上讲，他应尽一切所能以确保自己任职新的海军作战部长，他认为如果不这样就可能使海军的未来地位受到严重影响。
珍珠港并不是解决这个问题的地方。大多数的问题在华盛顿瞬息万变。其他人的任职均迫在眉睫，即使尼米兹不乐于承认，他还是不信任福雷斯特尔，在这方面也不信任杜鲁门。如果克罗克斯和罗斯福总统仍在位，这一任命当稳操胜券。事实上，谣言四起，说是福雷斯特尔又改变主意，尼米兹不在考虑之列。
又是运气，一位老朋友威廉·沃耳多·德累克来到檀香山。德累克在战争初期，曾是尼米兹手下负责公共关系的军官，他目前为"盟军赔偿委员会"美国总统的代表埃德温·波利工作。波利是帮助杜鲁门进入白宫的人，尼米兹认定这是个好机会。
尼米兹要求德累克把波利带到珍珠港来。由于德累克要经过此地赴日本，他就答应了。但波利怀疑上将另有意图，因而他们做了一次个别谈话。
尼米兹同波利离开总部，驱车去海滩，他们可以在此单独谈话。在长时间交谈之后，这位有说服力的特使成为尼米兹的新朋友，他确信，由尼米兹接任海军作战部长具有重要意义。波利立即返回总部，直接与白宫通话，向杜鲁门总统提出建议。这种通话只有少数几个人可以办到，杜鲁门的回答并不那么使人称心，他对波利说："好，我乐于帮助他，但福雷斯特尔坚持说他是一个顽固不化的德国人，他不适于担任这项工作，福雷斯特尔也不想要他干。"
正如尼米兹的怀疑，是福雷斯特尔搁置了这项任命，而杜鲁门又表示同意。尼米兹的未来处于危险之中，一周之内，尼米兹返回华盛顿，他要办三件事：动员海军的首脑人物支持他，出席参议院的委员会以及说明他的新的立场，他无意让海军退避三合，此时海军比任何时候更需要有强有力的发言人。
此时，在华盛顿，以艾森豪威尔为首的陆军正在不遗余力地宣传各军兵种合并的理由。而以杜利特为代表的航空兵则希望组成一支独立于陆军和海军之外的力量。战争期间，尼米兹曾一直主张统一作战指挥，而在这一时刻，他经过认真考虑，改变了自己的看法。
他不愿因为改变了主张而表示歉意，他在委员会上直言不讳地说："现在我的看法是根据新获得的经验进一步研究后形成的。我此刻确信，成立一个单一的部不能像两个独立的部那样有效地完成任务。实践证明，两个部分立是可以按现代战争的要求提供不同兵种的。我还确信，将陆军部和海军部合并为一个单一的部，不但无助于而且有害于恰当分工和有效地使用海上力量。"尼米兹极具信心地重点强调海权，反复申明他在欢庆胜利时的讲话：是海上力量赢得了太平洋战争。
杜鲁门先生获悉尼米兹将返回华盛顿时，他已经向尼米兹发出邀请，尼米兹毫不迟疑应邀前往。尼米兹得以晋见总统，这是他的华盛顿之行的另一重大收获。会见为私人性质，无谈话记录。但可看出这次会见产生了良好的效果。杜鲁门在退休后写的回忆录中谈到了对尼米兹的评价"从一开始我就认为尼米兹将军作为一位战略家、领导者和一个普通人，都是一位不同凡响和出类拔萃的人物。我把他同乔治·马歇尔将军并列为军事天才和政治家。"
杜鲁门、尼米兹会晤后的第二天，即11月20日，杜鲁门举行记者招待会，宣布和平时期高级军事将领的任命。艾森豪威尔上将接替马歇尔上将，任陆军参谋长；尼米兹上将接替金上将，任海军作战部长；约瑟夫·麦克纳尼上将接替艾森豪威尔，任驻欧盟军最高司令；斯普鲁恩斯上将接替尼米兹，任太平洋舰队总司令。参议院一致通过了上述任命。
二、任职作战部长
尼米兹的任命立即生效，这使他几乎无时间将家庭迁往华盛顿，也无充足时间交代他在珍珠港的各项工作。福雷斯特尔对此任命甚感不悦说，对于金上将挟持总统而强人所难亦甚为不悦，因而他要求两人立即交接。福雷斯特尔急于要金上将退休离开海军部。相反，他又不急于要尼米兹接替此职，这个人处于双层困境中，他对人抱着一种奇怪的先入为主的怀疑，同那些与他共事的人员总是不一致，而他与尼米兹共事的日子里并无龃龉。
1945年12月15日，在海军部举行了简单的交接仪式，首先，由金发表讲话，然后尼米兹宣誓就职。福雷斯特尔部长对出席仪式的参谋军官和家属们说："我不想把这说成是忧伤的场合。我认为正好相反。"但他接着解释说，他并不认为同即将离任的部长告别是一件愉快的事，他在讲话中对金做了赞扬。
尼米兹新任海军作战部长，他像管辖他的舰队一样，以充分的威望和纪律管辖他的办公机构。尼米兹请福雷斯特尔参与他所有重要的商讨、会议和决策，从表面上看，两人似乎通力合作。尼米兹辛勤工作，与同事们融洽相处。事实是，福雷斯特尔是文职人员又是总统指定委派的，这本身就存在着问题。但是尼米兹利用时间，努力适应和变通部长的烦恼心境和工作方法。实际上，尼米兹从未像现在这样辛劳，士兵复员和撤消部队建制，这些工作使得他星期天也不能休息。公众想要亲属迅速回家的情绪，使舰艇退役以及和平时朋的军队改组工作，受到不适当的时间限制。海军部出现的情况如实地反映了全国的情况，全国削减各方面的国防开支和拨款。机关人员在削减，华盛顿的一些机构迅速撤消。
除沉重的办公室工作外，尼米兹还经常被邀请去做演讲，他也高兴地应邀前往。他既是海军又是国家从事某种公共关系工作的人员。此后两年，凡是重要的组织集会总要邀请尼米兹去做演讲，有些讲稿由他自己撰写；有些是由别人给他写的，这项博取公众舆论的工作可能是尼米兹任海军作战部长的最重要的工作之一。
他传播消息，讲述故事，教育美国人民了解战争，了解各战役，了解和平的必要性。举国上下均为原子弹的威力而心存余悸，他们对于将它作为武器使用是否违背人道主义精神，以及将它用于和平进步事业，都提出了许多问题。当时，有关原子弹用于战争还是用于和平计划，许多荒诞无稽之谈和错误的说法广为传播。
四面八方的邀请函几乎使他应接不暇，有时一天之内要到三个不同单位做三次内容不同的演讲，这使得博闻强记的尼米兹终于闹出了笑话。
一次，他应邀到一个军官服务组织做演讲，临行，当副官向他介绍这个组织的情况时，他说："不需要给我说这个组织了，我当航海局长时就是这个组织的老前辈了。"
但当他开始演讲之后，副官发现他搞错了听众，他不断提到和赞扬的不是听演讲的军官服务组织，而是这个组织的对手"联合勤务组织"。尼米兹只得私下向该组织主席道歉："我了解你们的组织，它是个了不起的组织，我深深地致以歉意。"
尼米兹夫妇喜欢参加和举办聚会，对此，他们从不吝惜时间。在聚会上，尼米兹将军总要讲一两个有关士兵或水兵的故事。他最喜欢讲的一个故事是从奥马尔·布雷德利将军那里听来的。这是个很长的故事，尼米兹将军使出他招揽听众的最大本领，以最精彩的细节来描述。故事是这样的：一个年轻的士兵，根据"士兵权利法"进了个助产训练班。他获得文凭后，回到老家小镇上租了间铺面，买了个装满器械的医疗箱，挂牌开业。
一个礼拜过去了，也没人来看病。这天，一个神情紧张的农民跑进士兵的诊所找助产士。他听说这个男人自称是助产士大吃一惊，最后看到了文凭才相信。"你一定要去，"农民说，"因为我们惟一的医生不在镇上，到离这儿还有九十英里的地方去了，我老婆要生了。"他们坐着农民的老爷车到了农场后，士兵穿上白大褂，告诉这位丈夫安下心来去看看杂志。然后他提着黑色医疗箱走进卧室。十分钟后，他把门打开一条缝，说要一把螺丝刀，接着又把门关上。这位惊慌的农民拿来一把螺丝刀，敲了敲卧室门。士兵把门开了一条缝，说："很好，我要的就是它，你去看你的杂志，不用担心，一切都会好的。"
过了二十分钟，士兵又站在门口，表情有点忧郁。这次他要一把带有弹性的刀。农民拿来后，士兵再次叫他放心，然后又关上了门。又过了二十分钟，士兵又把门开了一条缝，说："先生，不知你有没有一根硬一点的电线，最好是一头带钩子的电线。"
农民从来没碰到过这种事，不过他还是拿来一根电线做的挂衣钩。士兵又开了条门缝说："很好，不要着急，坐下来等着。"