「己未」咸丰九年，公四十九岁。
正月，公在建昌营中，奉谕旨通筹全局。十一日，公具摺奏称：数省军务，安徽吃重，江西次之，福建又次之。计惟大江两岸，各置重兵，水陆三路，鼓行东下。剿皖南，则可以分金陵之势；剿皖北，则可以分庐州之势。北岸须添足马步军三万人，都兴阿、李续宜、鲍超等任之；南岸须添足马步军二万人，臣率张运兰等任之；中流水师万馀人，杨载福、彭玉麟任之。至江西军务，分南北两路，臣当与抚臣耆龄分任之。粤贼勾结捻匪，近来常以马队冲锋，拟调察哈尔马三千匹，募马勇数千，择平旷之地，驰骋操习。臣愿竭数月之力，训练成熟，皖豫军务，可期大有起色。附片请敕健锐营、内外火器营选派精练弓马、曾经战阵之员，咨送来营。并奏调翰林院编修郭嵩焘、礼部主事李榕二员。又片奏江西南路防剿吃紧，暂难移师北行，请饬赣南镇总兵饶廷选带兵来江，驻防南路。是日，又奏陈明李续宾死事甚烈功绩最多一摺。又奏陈臣弟曾国华殉难情形一摺。奉上谕：“巡抚衔浙江布政使李续宾前在三河阵亡，业经降旨，优加褒恤。兹据曾国藩胪陈该员功绩具奏，览之，亦深悼惜。李续宾从军数载，所向成功，乃其见危授命，麾下将士无一偷生，实有古名将之风。允宜垂诸信史，百世流芳。著将曾国藩奏交国史馆采入列传，以示褒嘉。”钦此。又奉上谕：“曾国藩此奏伊弟曾国华殉难情形一摺。候选同知曾国华在三河镇殉难，当经降旨，追赠道员，从优议恤。
该故员历著战功，一门忠义，著再加恩，赏给伊父曾骥云从二品封典，以示褒嘉。“钦此。同日又奉上谕：”曾国藩奏遵筹全局请添马队进取一摺。该侍郎统筹全局，意在并力大江两岸为节节进剿之计，所见甚是。惟现在江西南赣等处贼氛尚炽，该侍郎未能即日北行。俟南路稍松，再赴楚皖交界，筹办大局。编修郭嵩焘现随僧格林沁前赴天津，俟该处撤防，再降谕旨。主事李榕已令赴营差委。汝弟曾国华在三河阵亡，可嘉可悯，业经追赠道员，从优赐恤。该员之子，例有应得世职。本日复明降谕旨，赏给伊父曾骥云从二品封典，以示褒奖。“钦此。公作《圣哲画像记》，图画昔时圣贤先儒三十三人，系之以说明，抗希古人之意，略依孔门四科及近世桐城姚氏论学，以义礼、考据、词章三者，分门依类而图之。
官军攻景德镇小挫，公调驻防广信之平江勇等营赴镇助剿，饬张运兰等坚守营垒，与贼相持，军心以安。萧公启江击贼于南康县，大破之，克新城墟及池****垒。
二月初三日，萧公启江等攻克南安府城，收复崇义县城。贼酋石达开纠党西窜，入湖南境。初四日，公在营中，行大祥祭礼。初九日，奏报萧启江一军胜仗，阵亡将弁龙复胜等十七名请恤。又奏张运兰一军攻剿景德镇情形一摺。汇奏水陆各军阵亡病故员弁何长庚等八十员名，开单请恤。又奏汇保新城、安仁两案老湘营、平江营出力员弁兵勇开单请奖一摺。是日，又具摺谢弟国华从优赐恤恩，又摺恭谢年终恩赏。附片奏：邓辅纶捐造战船请叙一案，经工部咨查何项工例。臣查江楚创造战船，本系臣新立规模，并未仿造他省战船成式，实无工例可援，仍请照前案议叙。奉朱批：“著照所请奖励该部知道。”钦此。十一日，公查核报销七柱清单。公闻闽省已无贼扰。十二日，由建昌拔营，移驻抚州。李贵武公遗骨，经难民收得，负送大营。胡公林翼遣弁觅得公弟愍烈公遗骨，而丧其元。公闻而益悲之。胡公委员弁先后殓送回湘。十五日，公在途次驰摺奏报萧启江一军，协同各勇攻克南安府城，现在引兵驰援信丰县，江省南路可望肃清。随摺奏保道员萧启江请加勇号。附片奏移军抚州，距景德镇较近，军中声息易通。又具摺恭谢天恩，并奏称：臣胞叔曾骥云，臣在侍郎任内，恭遇两次覃恩，曾邀封至正一品光禄大夫。兹复渥荷褒嘉之典，诰轴则祗领新纶，顶戴则仍从旧秩。奉上谕：“前因曾国藩奏伊弟曾国华殉难情形，当经赏给曾国华之父曾骥云从二品封典。
本日曾国藩谢恩摺内，声明曾骥云曾邀封正一品封典等语。所有曾国华之子曾纪寿，著再加恩，俟及岁时，由吏部带领引见，以示朕褒崇忠节有加无已之至意。“钦此。十六日，公至抚州，赁城内谢氏宅以为行馆。萧公启江援剿信丰县，力战贼解围去。贼之窜湖南者，连陷桂阳、郴州各城邑，攻扑永州府。江西南境馀匪相继西窜。公乃调萧启江一军，驰赴吉安府境，以为湖南援应之师。骆公秉章亦奏调萧启江由间道回军湖南，听候调遣。自是南路军饷，不复关公虑矣。公以景镇之贼，久攻未克，委副将朱品隆、游击喻古三、知县张岳龄、县丞凌荫廷等，回湖南续招湘勇四千人，赴抚州训练，以备攻剿。二十七日，派委员弁巡查抚州城防。二十八日，具摺奏谢弟国荃保选用知府加道衔恩。又奏报萧启江一军力解信丰城围，现在飞调该军驰赴吉安为湖南援应一摺，阵亡将弁李先益、李楚文、黄龙光、刘文友请恤。附奏添招练勇，即由江西添筹月饷一片。
三月，朱品隆所募乡勇先后抵抚州。公按日阅操，传见各营哨官，时时训饬之。十三日，张公运兰击贼于景德镇，军势复振。刘公腾鹤领湘军驻防湖囗。皖南之贼窜陷建德，刘公进剿阵亡。公调派平江勇千人，委知府屈蟠领之，以防湖囗。二十六日，奏报景德镇官军两月以来攻剿情形一摺。阵亡将弁喻福庆、易福升等五十二员名，开单请恤。附片奏添募湘勇，在抚州教练，俟吉安防务稍松，即调派各营合攻景镇之贼。又具摺奏谢曾纪寿由吏部带领引见恩。是月，李武愍公****攻剿庐州阵亡。
四月，湖南永州解围，贼以全股围扑宝庆府城。公弟国潢治团练于乡邑。湘勇从军在外者，人怀家乡之虑。公札饬各营官禁勇丁告假回籍。委员至衡州府城，坐探湖南贼势军情，三日一报，随时函告各营以慰之。公出城阅视操演，其队伍整齐者，亟犒赏以奖励之。二十五日，拜发万寿贺摺，专弁入都。二十七日，公弟国荃到抚州营。
五日初九日，公与弟国荃设次行释服礼，仿《通礼》中品官祭仪，而略变通以行之。初十日，派调湘军之在抚州者旧部四营、新募者七营，为数共五千八百人，公弟国荃总领之，赴景德镇助剿，李公鸿章同住赞画。二十二日，总兵饶公廷选来见公。二十六日，奏报楚军进攻景德镇连获胜仗，现在添军助剿一摺。附片奏饬九江道沈葆桢赴本任，调总兵饶廷选接防广信。又奏记名道编修李鸿章留营襄办军务，檄令会同曾国荃等督剿景镇。又奏陈明服阕日期一片。时公麾下各军悉赴景德镇，其留防抚州者千数百人，皆本归江省调度之营，借公为之镇抚而已。
六月初三日，礼部主事李榕来抚州见公。湖南贼围宝庆，久不解，萧公启江军亦至宝庆。总督官文公奏探知湖南贼势将窜入蜀，请令公带兵赴夔州一带，择要扼守。奏上谕：“官文奏请饬曾国藩迅赴夔州一摺。详览该大臣所奏各情，实为通筹大局起见，本日已谕令有凤派兵扼要严防。惟该省兵力恐不能当此悍贼。
曾国藩前派萧启江带兵援剿湖南，现在湖南吃重，此一军自未能调回。此外如江西、湖北等兵，素称得力，著曾国藩即日统带，由楚江前赴四川夔州扼守，以据两湖上游之势。倘贼踪窜至，即可有备无患。至江西景德镇之贼，尚未剿平，著曾国藩斟酌情形，咨商耆龄，妥为布置。俾得迅扫逆氛，不至顾此失彼，是为至要。“钦此。公弟国荃督军至景德镇，三战皆获胜。十四日，克景德镇。贼窜浮梁县。十五日，公弟国荃、张公运兰等追击贼于浮梁，克之。贼溃入徽州境。江西全省肃清。十八日，复奏寄谕防蜀一摺。奏称：臣所部兵勇为数无多，目下景德镇攻剿之师，难以遽行抽动。若令由鄂赴蜀，应须兵力稍厚，乃可携以入峡。
维时湖南宝庆贼势犹盛，湘军既克景镇后，弁勇等思归尤切，势不能止。公乃调张运兰引军回湘，以援宝庆。拟自率六千人，溯江西上至宜昌，驻军扼湖广之西路。二十二日，驰奏克复景德镇及浮梁县城，江西全省肃清一摺。奏称：曾国荃系臣亲弟，不敢仰邀议叙。随摺奏保道员张运兰、王文瑞、游击任星元三员，阵亡都司李印典、守备向其昌、陈玉才、高成春请恤。附片奏：调张运兰一军会剿宝庆，以副弁勇迫救桑梓之情，可期得力。臣拟先驻湖北宜昌等郡，如贼果入川，再行酌量前进。又奏保已革编修吴嘉宾、前奏保升同知，经吏部核驳，请以内阁中书选用，并加五品衔。又片奏副将黄翼升复姓归宗一案。二十八日，张公运兰拔营回湘。公弟国荃率吉字中营拔赴抚州。公饬调朱品隆等军由景镇拔营，取道湖囗渡江，驻军于小池囗。
七月初一日，公弟国荃至抚州。公作《林君殉难碑记》刊石立于抚州城外林源恩殉难之处，以表其忠。初六日，奏报景镇官军分两路赴楚拔营日期一摺，奏保萧启江一军南安、信丰两案出力员弁，开单请奖。附片奏：臣前在江西，重整水师，设立楚师子药炮位三局，历时三载有馀，始行裁撤，请将该局员量予保奖。
公弟国荃以病留抚州数日。初七日，公由抚州启行，绅民酌酒于路，以饯公行。
初十日，公行抵南昌省城，奉上谕：“现在江西全省一律肃清，剿办甚为得力。
曾国藩调度有方，著交部从优议叙。在事出力之道衔候选知府曾国荃，著免选知府，以道员用。“钦此。李公续宜由黄州率军回援湖南，击贼于宝庆城外，大破之。石达开窜入广西境。湖南解严。公弟国荃病愈，由抚州拔营回湘。公弟国葆更名贞干，从军于黄州。胡公林翼奏办理军事，是月至抚州，旋至南昌见公。沈公葆桢见公于南昌。十五日，公登舟启行，李公瀚章、鸿章皆从。十七日，泊吴城镇。李公瀚章所设报销总局在焉。十八日，核阅报销清册。十九日，泊湖囗。
彭公玉麟、杨公载福来见。公棹小舟石钟山下，作《湖囗水师昭忠祠记》，彭公立石焉。是月奉上谕：“该侍郎原摺所称驻札宜昌等处，即可稳占上游，但为镇守湖北起见，尚未筹防蜀省。曾国藩当熟思大势，应如何定计之处，详悉驰奏，毋得迁延。”钦此。又奉上谕：“曾国藩虽先驻宜昌等处，仍当侦探贼情。如宝庆一带未能遏其入川之路，即当亲督兵勇赴蜀，以便调度堵剿机宜，未可迁延贻误。”钦此。又奉暂留兵勇赴徽州会剿之旨。又奉酌拨兵勇留防江西之旨。二十五日，复奏四次谕旨一摺。奏称：江西北路，饶州有刘于浔一军，彭泽有普承尧一军。臣与耆龄熟商，拟令饶廷选、吴坤修各添置一军，或以留防本省，或以助攻皖南。臣所带领人数无多，不能抽拨赴皖，亦不能酌留防江。臣筹防全蜀，断不能迁延贻误。俟抵鄂后，察看贼势，与官文、胡林翼会商，再行驰报。是日，又奏摺恭谢天恩交部优叙，弟国荃以道员用。公舟次湖囗，所调朱品隆、唐义训等营咸集，驻营于江之两岸。触暑多病，公留湖囗旬日，令各营休息医调。
八月初一日，札调朱品隆拔营，由陆路赴鄂，驻扎巴河。公舟解缆，溯江而上，泊九江，谒先贤周子墓。十一日，行抵黄州，与胡公林翼相见于行馆，留七日而行。公在舟中，定每日静坐读书日课。武昌门人张裕钊谒见公舟中，公教以文词甚详。途次奉到上谕“官文奏皖省贼势日张筹议由楚分路剿办一摺。皖省粤匪与捻匪勾结，蔓延日甚，官文以宝庆解围，败贼悉数南窜，川省已有备无患。
请饬曾国藩缓赴川省，暂驻湖囗，分军四路进剿皖省。所筹实于大局有益，曾国藩如已启程赴鄂，著与官文商酌。如湖南大局已定，川境可保无虑，即暂驻湖北，调回湖南各军，为分路追剿皖省之计“等因。钦此。二十三日，公至武昌省城。
与官文公会商军事，留旬日。是月公弟国潢、国荃迁葬竹亭公、江太夫人于台洲新茔。胡公林翼委公弟贞干回湘募勇二营，赴鄂助剿。
九月初三日，公由武昌解缆回黄州。与胡公林翼商筹进兵皖省之途，须分四路：循江而下者为南二路，循山而进者为北二路。胡公拨派兵勇十营，隶公麾下。
初五日，至巴河登陆。驻陆营中，接见各营营官、哨长，简校军实。胡公林翼至公营视师。十二日，驰奏遵奉谕旨会商大略由鄂省回驻巴河一摺。催调萧启江一军，克日前来，会师东下。副都统多隆阿公攻克石牌贼垒，进规安庆。二十五日，公至黄州。留二日还营。李公鸿章奉旨授福建延建邵遗缺道，留公营幕中不之任。
两淮贼氛肆扰，胜保、翁同书督师屡失利。漕运总督袁公甲三奏请以公一军，由河南光固进剿，遏贼北窜。奉上谕：“袁甲三等所虑，不为无见。著官文、曾国藩、胡林翼再行悉心筹酌。至此次官文等会筹大举，关系全局利害，总须计出万全，不妨稍迟时日，谋定后动也。”钦此。
十月初一日，核定马队营制章程。初二日，公弟国荃领所部吉字营勇至巴河。
公弟贞干领所招乡勇至黄州。初八日，见公于巴河。十七日，会奏悉心筹酌一摺。