缺钙除了看身体的症状表现外，还应结合临床医学检查来进行诊断。
由于人体内钙的代谢受严格控制的体内平衡机制调节，因此还没有评价人体钙营养水平的理想方法。因此，如何评价人体的钙营养状况仍然还是一个有待解决的课题。目前人体钙营养状况的评价方法是采用综合方法，包括总体骨矿物质含量测定（医疗机构使用双能X射线吸收仪，而不是商场中央摆放的单光子骨矿物质含量测定仪）、每日膳食钙摄入量计算、人体钙平衡（摄入量—排出量）、血清中离子钙含量以及其他与钙代谢有关的激素水平。但是应注意，骨骼矿物质含量多少或骨密度大小不仅仅是营养的原因，也有其他的原因，例如遗传、年龄、身高、缺乏适当的体育锻炼、体重减少、性激素缺乏、药物和吸烟以及许多疾病和相应治疗的影响等都会影响骨骼代谢，并且骨密度的个体变异大，还有季节变异的情况。
1.X线检查和双光能骨密度仪检查
影像学中的X线摄像是反映骨钙化程度的指标，主要用于小儿佝偻病的诊断与临床分型。当孩子患佝偻病时，X线摄像检查可见临时骨钙化带模糊或消失，干骺端增宽，边缘不整呈毛刷样、杯口状改变。但这种方法不易发现早期病人和临床前期或亚健康人群等重点预防对象。骨密度仪是测量骨骼中矿物元素的含量，也称骨密度。骨密度的高低能准确反映骨矿含量，诊断数据可靠，但需特殊仪器，目前仍不能普及。
2.骨源性血清碱性磷酸酶
大量研究证实，骨源性碱性磷酸酶（BAP）是反映骨代谢状况的理想生化指标。BAP由成骨细胞合成，当人体钙营养不良时，成骨细胞反馈性增生活跃，分泌大量BAP释放入血，造成血中BAP活性升高。所以在佝偻病早期，血中碱性磷酸酶就开始升高，而且随病情加重，升高幅度加大。当钙得到补充，病情好转时，血中的碱性磷酸酶又随之下降。因此，碱性磷酸酶是反映骨代谢状况的理想生化指标。为了便于推广这种检查方法，中科院生物物理研究所组织国内专家研制出了测试儿童和成年人血清碱性磷酸酶的试剂盒。这种试剂盒只需要微量末梢血液即可测试。其诊断小儿佝偻病的准确率高达92.3%。
另外还可以采用称重法、记账法、食物频率法或24小时询问法等方法调查个体或人群的一天或一段时间的食物消耗量，然后根据食物成分表计算日钙的摄入量，将计算结果与中国营养学会推荐的每日膳食钙供给量进行比较，看是否缺钙和缺钙量多少。
其他的测钙法还有钙平衡试验法等，但钙平衡试验测定中评价单个体的钙摄入量需要由经过训练的专业人员来完成，而评价自我选择膳食个体的钙摄入量也并不是件容易的事。
需要注意的是，近年来国内多数大城市的大商场在明显位置常会看到摆放着商家提供的单光子骨矿物质含量测定仪，免费为过往购物人测定是否“缺钙”，然后推销事先准备好的产品。这样的做法存在许多问题：首先，将这种仪器摆放在公共场合不符合国家关于放射性仪器管理条例，因为这种仪器操作时使用的是放射性同位素，使过往行人和观看者接触到辐射，尤其对于孕妇是不合适的；第二，操作者应经过国家有关部门的培训，并持有上岗许可证；第三，关于使用单光子骨矿物质含量测定仪获得的结果，目前还没有公认的诊断标准；第四，测量结果的人为可操作性大；第五，使用这种仪器不能直接测出骨密度的结果，只能得出骨矿物质含量和相对骨密度骨矿物质含量/骨宽度。