科室设置逐渐完善
1906年宏恩医院创办时，设置门诊部和住院部，以后的天主堂医院和湖南省立沅陵医院，均分此两部。在科室设置上，三所医院除设置内科、外科、妇产科、药房、化验室、手术室（开刀房）外，省立沅陵医院还设有传染科、牙科、爱克斯光室。
1952年，三所医院合并为沅陵人民医院后，医院设置内科、外科两个住院部，其中内科住院部只设内科（包括小儿科）；外科住院部分设外科（包括五官科、皮肤科、手术室）、妇产科、药房、化验室、爱克斯光室和门诊部。
1952年，撤销省立沅陵卫校，卫校的房屋交给医院使用，医院科室逐年增加，在设置上也逐渐适应治病防病的需要。1956年，医院增设了中医门诊和中药房，1957年成立了中医科。1962年分设儿科，次年，又增设了供应室。1969年，县防疫站、妇幼保健所与县人民医院合并，迁入医院办公，增设一个预防组，后扩大为传染科。1970年，加大中西医药结合，成立新药科，主要研究和推广中西医结合疗法，1971年更名为新医科，后在1981年时更名为中医科。1973年，在五官科门诊增设牙科诊疗室。1977年将化验室改为检验科，将爱克斯光室和理疗室合并为放射科。同年，医院还建立起心电图室、A超室和药剂科。
党的十一届三中全会后，医院加大整顿，护理工作得到重视，1979年分设五官科，成立护理部，更名药剂科为药械科。1982年将总务部分为财务科和总务科，并成立保卫科和胃镜室。1984年，应社会和群众的需要，成立家庭病床科和医务科。至此，医院各科室设置基本完备，能够满足群众看病需要。
截止1984年，医院科室设置与分布基本大定。其中院部包括一室三科，即院办公室、总务科、财务科、医务科；医务科内设三室，分别为护理室、病案统计室、图书室。门诊部包括肠道诊断室、内、外、五官、妇产、中医诊断室、注射室、换药室、小手术室、急诊观察室。住院部包括传染科、外科、内科、中医科、妇产科、五官科、小儿科。家庭病床科包括草药门诊、针灸、按摩等。药剂科包括制剂室、药检室、中西药库、中西药房、煎药室。医技科室有检验科、放射室、手术室、供应室、理疗室、心电图室。后勤科包括财会室、住院挂号室、职工食堂、病人食堂、锅炉房、洗衣房、幼儿园、修理组等。
1986年，医院根据业务发展需要，将急诊室扩大为急诊科，并合并胃镜室、心电图室、A超室，组建成为特检科。1987年，医院增设B超室和老干科。
抓住五强溪库区移民搬迁，沅陵重新规划建设新县城的机遇，沅陵县人民医院经过一段长时期的艰苦努力，终于走出没有医疗用房和医院办公用房的低谷，先后修建了属于医院自己产权的门诊大楼、住院部大楼和综合大楼。这些大楼的修建，为加大科室合理配置，减少病人转诊，方便患者就医需要提供了良好的基础条件。尤其是2005年以来，医院在百年发展的基础上，新增了一批与时俱进的科室，使医院焕发出新春，更加适应社会发展的需要。2005年3月，医院成立了传染病管理科。2006年1月，成立怀化市四方司法鉴定所和120医疗急救中心。120医疗急救中心实行城内急救免费接诊，对一些需要急救的重、急症及突发事故患者敞开了一条绿色的生命通道。
2006年10月，新成立的医院领导集体，重视人才使用，努力发挥学科优势，在大力培养和引进人才，建设医疗业务技术人才梯队的同时，积极引进开展适宜新技术项目，充分发挥人才作用，向科技兴院的目标迈进。为推动医院的医疗技术创新，尽快实现学科的跨越式发展，医院建立健全了科技创新激励机制，鼓励医务人员积极开展临床科研活动和撰写学术论文。根据医院第六届职工代表大会通过并已实施的《医院工作管理奖罚办法》，加大对技术创新和科研项目的奖励力度，鼓励积极引进适宜新技术项目和新疗法。各临床科室充分利用现有条件，挖掘自身潜力，发挥学科优势，积极创造条件开展新业务，为医院新一轮发展寻找新的经济增长点。普外科、泌尿科、妇产科的医生人人掌握并积极开展了腔镜手术，儿科的新生儿重症监护、五官科的鼻内窥镜、传染科的肝病治疗等发展步伐也明显得到加快。医院注重加强科技合作与创新，采取聘请上级医院专家来医院指导或外出进修以及与上级医院合作等形式，积极开展二级医院以上的技术，相应成立心理治疗科、中西结合科、疼痛科、神经康复中心、泌尿外科、介入治疗、血液透析等新项目。同时采取“借鸡生蛋”模式发展医院，把“有多少钱就办多少事”的观念转变为“要做多少事就去找多少钱”的新理念，大胆借助厂家、公司及经销商的设备投入、投资、分期付款或合作，引进先进的医疗设备。仅用半年时间，就着重建设了儿科，添置了蓝光治疗仪、恒温箱、微量注射泵、高压氧和小儿呼吸机、小儿保健设施、微量元素测定仪，完成小儿高压氧舱的操作培训，每个科室都建立了危重病抢救病房，添置了心电监护仪、呼吸机（个别科室配置了除颤器）、输液泵、换药车、治疗车，部分科室添置了抢救车和担架床；检验科添置了血球仪（五分类血球仪，怀化地区县级医院第一台），扩大了血细胞的检验分类范围，为临床提供了完整科学的检测数据；添置了化学发光仪，能检测甲状腺功能、糖尿病相关免疫学检测、肿瘤相关检查和男女部分激素水平的检查，结束了此类检测空白的历史；内科建立了中央遥望监护系统；妇产科添置了妇产科腹腔镜、阴道镜，更换了橱柜，衣柜，检查床等。半年间共添置和更新设备近300万元。到2010年，医院先后引进了总价值2100万元全自动五分类血液分析仪、彩色B超以及沅陵县唯一的最新治疗器械——高压氧治疗舱、多排螺旋CT等20多种医疗设备。截止2011年，医院已经拥有16层全进口螺旋CT、全进口血液透析仪、彩色B超、全自动生化分析仪、800mA数字X线机、电视腹腔镜、心电工作站、血气分析仪、全能麻醉机、电子胃镜、经颅多谱勒、全自动呼吸机、五分类血球仪、化学发光仪、中央远望监护系统多参数心电监护仪、除颤器、阴道镜、鼻内突窥镜等。在儿科，拥有恒温箱、蓝光治疗仪、小儿高压氧舱、儿童保健、小儿呼吸机、微量元素测定仪、智力测定仪等高新医疗设备100多台（件），完善了开展新技术项目所需的医疗设施，肝胆外科、骨科、眼耳鼻喉科、儿科、妇产科、心血管内科、神经内科是医院的重点学科，能成功开展肝叶切除、脾部分切除、直肠癌根治术、乳腺癌根治术、胆总管囊肿切除、腹腔镜下阑尾切除、子宫肌瘤切除等手术；还有开颅手术、哈氏棒、椎弓钉治疗脊椎骨折截瘫、泌尿系统结石手术、前列腺摘除、白内障超声乳化晶体植入术、陈式子宫全切、无痛人流、脑血栓溶栓术、心肌梗塞溶栓术、脑溢血微创血肿清除引流术等新技术和新疗法。医院跻身进入了全市县级医院医疗水平先进行列。
2011年，医院又增加了神经内科、重症医学科、血透中心、肾内科、中西医结合科、沅陵县急救中心和远程会诊中心。这些科室成立后，进一步拓展了人民医院的业务范围，方便了群众看病治疗，提升了医院的市场竞争能力。尤其是远程会诊中心的建立，有效地共享到全省医疗技术资源，使沅陵山区群众在家门口就能享受到医学专家和教授提供的优质服务，从很大程度上缓解了沅陵百姓看病难和看病贵的问题，深受社会各界好评和赞誉。
现将2011年沅陵县人民医院临床科室简介如下——
湖南省沅陵县人民医院座落在沅陵古镇辰州街的沅水河畔，与名胜风景区凤凰山隔河相望。是一所享誉湘西融医疗、教学、科研、预防保健为一体的国家二级综合性医院，政府非赢利性医院。湖南省人民医院临床指导医院、怀化医专临床教学医院、怀化市第一人民医院对口支援医院、县医疗急救中心、县高危孕产妇抢球中心、医保定点医院、新农村合作医疗定点医院、怀化市四方司法签定所挂牌医院。《跨越百年的医院》讲述该医院从1906年（清光绪三十二年）由英国基督教会创建的宏恩医院经过历史的涤荡发展为现今颇具规模的现代化医院的艰苦历程，并介绍了具有创新精神的医院管理理念，值得行业内人士借鉴、学习。
门诊部 沅陵县人民医院门诊部为医院的服务窗口，是集日常医疗、保健科研、教学、心理咨询、卫生宣教、计划免疫及行政管理于一体的功能部门，承担着疑难危重病人的救治和会诊工作。沅陵县人民医院门诊部规模大，现有诊断室20间，设有内科、风湿免疫、外科、眼科、耳鼻喉科、神经内科、传染内科、皮肤性病科、中医内外科、理疗康复科、针灸科等10余科室。各科分设各种专科、专病门诊，门诊部设有下列辅助科室：药房、放射、检验、病理、心电图、超声心电图、B超、脑电图、肌电图、电子胃镜、电子结肠镜、螺旋CT等一系列先进的医疗设备，为高效、准确的诊断治疗提供了强有力的保障。
门诊部建立健全了各种规章制度，医务人员严格执行各项技术操作规程。近年来，门诊医师中，副主任医师以上的职称占25%左右，主治医师占74%以上，住院医师约占1%，确保了门诊医疗工作质量。
门诊部始终重视医疗质量，重视服务态度和医德医风建设，聘请了沅陵县主流媒体单位和沅陵县的一些知名人士担任医德医风监督员。各科室建立了意见薄，入院处给新入院病人散发《给住院病人的公开信》，挂号大厅公布各项收费标准，严禁发生乱收费的违法行为。门诊部坚持以病人为中心，努力创造条件，最大限度方便病人就医，努力提供优质服务。
外一科 沅陵县人民医院外一科是由肝胆外科、普外科、胸外科、泌尿外科组成的病室。现有医务人员24人，其中副主任医师2名、主治医师3名、主管护师2名。主治以上的5名医生先后在省人民医院以及湘雅医院进修深造，技术力量雄厚。发表国家级论文20余篇，省级论文8篇，有2篇获国家级优秀论文奖。科室可以开展肝、胆、胃肠、胰腺、乳腺、甲状腺、肺、肾脏、输尿管、膀胱、前列腺等外科疾病的手术治疗，具体的手术方式有肝叶切除、肝肠盆式内引流术、巨脾切除加门奇静脉断流术，胰十二指肠切除术、甲状腺全切、次全切除术、乳腺癌根治术、胃癌根治术，结、直肠癌根治术，开胸探查术，肾输尿管切开取石术、前列腺切除术等。尤其在微创手术方面更是技术独到，具体手术有：腹腔镜胆囊切除术加胆总管探查术，保胆取石术，腹腔镜脾脏、阑尾切除术，腹腔镜肝、肾囊肿切除术，输尿管镜下气压弹道碎石术，肾镜碎石、取石术，前列腺电切术等。2009年初，外一科在怀化全市率先成功开展了单孔腹腔镜胆囊切除术和单孔阑尾切除术，相比常规的三孔或四孔腹腔镜技术损伤更小，恢复更快。2011年初，外一科再次引进新技术，在腹腔镜和胆道镜双镜联合下开展了微创胆总管切开取石术，使医院的微创技术迈上新的台阶。此两项技术在全省市内名列前茅，给患者带来极大的福音。外一科各项手术成功率高、效果好，部分技术达到省内先进水平，吸引了沅陵周边县市大量患者慕名前来医院手术治疗。
外二科 沅陵县人民医院外二科是由骨科、神经外科、显微外科组成的综合性创伤外科中心。拥有医护人员17人，副高职称1人、中级职称5人。骨科在沅陵县率先开展了脊柱骨折椎根行内固定术，人工股骨头、人工全髋关节置换术，各种四肢骨关节复杂骨折手术，先天性骨关节畸形矫治以及骨髓炎、骨结核、骨肿瘤等手术治疗。新引进了臭氧、射频治疗仪，对急慢性颈肩痛、腰腿痛、四肢骨关节疼痛的治疗取得显着疗效。神经外科对重型颅脑损伤、颅内出血开展颅内血肿清除、去大骨瓣减压术及后续颅骨修补术，治疗技术成熟，治愈率高，成功挽救了许多患者的生命，并保存了良好的生存状态，得到了全县广大患者的一致信赖和好评。显微外科成功开展了患肢、患指再植术，四肢神经、血管损伤修复术，四肢畸形及四肢功能重建术，并开展游离皮瓣，带蒂皮瓣移植，为复杂、大面积严重毁损伤患者的治疗创造了条件，取得了良好的治疗效果。
内一科 沅陵县人民医院内一科是以心血管内科主要学科，辅以呼吸内科及内分泌科的重要科室，是人民医院的重点学科之一。科室技术力量雄厚，有良好的学科梯队。全科医护人员22人，医生7人，护士15人。其中高级职称1人，中级职称4人。开放床位49张，其中CCU设有5张监护床单元。拥有中央远望一托5心电监护仪及动态心电监护仪、24小时动态心电图、动态血压监测仪、除颤器、呼吸机及多台微量输液泵等一大批先进设备，对危重病人的抢救发挥了极大的作用。科室重视人才培养，先后选送多位医师到湘雅附属医院及省人民医院进修学习，并引进先进的诊疗技术及方法，从很大程度上提升了对心血管疾病的正确诊断，使危重病人的抢救成功率得到大幅度提高。科室擅长对顽固性心衰、各种心律失常、急性心梗、心肌病、难治性高血压等临床疾病的诊断、抢救和治疗。是连续三年医院创收排名第一的科室，多次获得沅陵县人民医院先进科室荣誉称号。
内二科 沅陵县人民医院内二科是诊治感染性疾病为主的综合性科室。科室以诊治肺结核、胸腔积液、各型病毒性肝炎、肝硬化、及其他感染性疾病和发热性疾病为主。近年来在全县突发性公共卫生事件如甲流和手足口病等的救治中发挥了重大作用，是全县救治甲流、手足口病的唯一科室。科室现有病床50张，拥有呼吸机1台、心电监护仪4台、雾化机1台、心电图机1台、除颤仪1台、便携式B超1台。有医护人员17人，其中高级职称1人，为怀化市感染专业委员会委员，中级职称6人，均有丰富的临床工作经验。科室学术气氛浓厚，近年来已有6篇学术论文在省级以上刊物发表。依托医院力量，能开展甲、乙、丙肝病毒检测，痰及胸腹水结核菌检查。
妇产科 沅陵县人民医院妇产科是沅陵县唯一产科急救中心，肩负着全县高危孕产妇抢救治疗工作。全科工作人员22名。高级职称1人，中级职称11人。