三月，禁漳泉人贩海。芝龙纵掠福建、浙江海上。
六月，兵都议招海盗郑芝龙。
九月，郑芝龙降于巡抚熊文灿。工科给事颜继祖言：『芝龙既降，当责其报效』。从之。
二年春二月，海盗李魁奇伏诛。魁奇本郑芝龙同党，芝龙忌之，击斩粤中。
夏四月，广东副总兵陈廷对约郑芝龙剿盗。芝龙战不利，归闽。不数日，寇大至，犯中左所近港，芝龙又败。寇夜薄中左所。
四年春正月，上召廷臣及各省监司于平台，问福建布政使吴旸、陆之祺：『海寇备御若何』？旸曰：『海寇与陆寇不同，故权抚之。但官兵狃抚为安，贼又因抚益恣，致数年未息』。上曰：『前抚李魁奇，何又杀之』？旸曰：『魁奇非芝龙比，即抚终不为我用。今钟斌虽抚，亦反侧不可保也』。上问：『实计安在』？祺曰：『海上官兵肯出死力，有司团练乡兵，多设火器，以守为战，剿之不难』。上问巡抚熊文灿，旸曰：『文灿才胆俱优，但视贼太易，故前有吉了之败』。祺曰：『锺斌与郑芝龙势不两立，七月闲斌扰福州，抚臣计诱往泉州。前闻抚臣同芝龙讨贼，僇其兄，贼遁去』。问广东布政使陆问礼，对曰：『广东海寇俱自福建至，舟大而多火器，兵船难近，但守海门勿令登陆，则不为害』。
五年冬十一月，海盗刘香老犯福建小埕，游击郑芝龙击走之。
六年夏六月，海盗刘香老犯长乐。
七年夏四月，海盗刘香老犯海丰。
十二月，总督两广熊文灿奏道将信贼目陷。时文灿令守道洪云蒸、巡道康承祖、参将夏之本、张一杰往谢道山招刘香老，被执。上以『贼渠受抚，自当听其输诚，岂有登舟往抚之理？弛备长寇，尚称未知，督臣节制何事』？命巡按御史确核以闻，已令文灿戴罪自效。
八年夏四月，福建游击郑芝龙合粤兵击刘香老于田尾远洋。香老胁兵备道洪云蒸出船止兵。云蒸大呼曰：『我矢死报国，亟击勿失』！遂遇害。香老势蹙，****溺死。康承祖、夏之本、张一杰脱归。
八月，香老家属六十余人、部属千余人至黄华，降于温处参军。
十三年秋八月，加福建参将郑芝龙署总兵。芝龙既俘刘香老，海氛颇息；又以海利交通朝贵，寝以大显。
十六年冬十一月，设南赣兵三千，以副总兵郑鸿逵统之。
十七年春正月，前兵科都给事中曾应遴荐副总兵郑鸿逵缓急可用，诏益南赣兵二千，命鸿逵镇守。踰年，鸿逵以舟师守镇江，我大清兵南下，溃归。郑芝龙降。
谷应泰曰：海上亡赖奸民多相聚为盗，自擅不讨之日久矣。盖以鱼盐蜃蛤商舶往来剽掠其间者累千金，利则乘潮上下，不利则啸聚岛中，俨然以夜郎、扶余自大，东南边徼益骚然苦之矣。
泉州人郑芝龙，筦库之子也。年未弱冠，为海寇颜振泉所掠。振泉爱芝龙状貌，因有宠。泉死，众推为魁。然而龙特饶智数，桀黠喜持两端，其它无绝殊者。
方其侵暴外洋也，输金于杨六，缓追于洪先春；黄巾未破于曹公，赤眉约降于光武，其持两端者一也。及其受抚内地也，私鬪则勇于魁奇，公战则怯于廷对；杀陈余于泜水，纵匡术于石头，其持两端者二也。又若拥兵闽越，援立外藩，定策功高，阖门横玉，而乃阴怀首鼠，百计沮军；滹沱既未合兵，东吴岂能遽下，居异人为奇货，以澶渊为孤注，其持两端者三也。又若关门既下，释甲入臣，居第京师，招摇海上，曾无麟阁之功，但比辽东之豕；隗嚣侍子而身反于外，延之在台而子更举兵，其持两端者四也。
夫奉先之失在于去就轻脱，故依建阳别背建阳，依董卓则背董卓；牢之之败在于天性反复，故附道子则反道子，附元显则反元显。今芝龙以盗贼之雄，挟遨游之智，而鹰眼不化，狼心已成，身在樊笼之中，志存江湖之上，一旦缓急，可得信乎？
然予又怪崇祯之初，芝龙既抚，锐意行金，织皮丹珀来目贾胡，明珠文犀至皆兼两，是以荐剡频上，爵秩屡败，坐论海王，奄有数郡。人但知元龟象齿都自淮来，而不知宝玉大弓原从鲁窃。若能却盗泉之水，则不至夺君子之器矣；说在孔子之对康子也。
附录二记荷兰人据台湾事（俞正变「癸巳类藁」一则）
万历中，台湾为日本倭所据。末年，荷兰红毛人自西洋来，欲据香山，不可，则据澎湖，又不可，乃南据美洛居及葛留巴。以鸦片烟诱葛留巴，葛留巴人俱臃腑不能动，役于荷兰。
既而荷兰聚集精锐，攻香山，战败，扬帆东走至澎湖。使人行重贿于福建巡抚，援意大里亚人居香山故事，以求澎湖必得。巡抚使人善谕之，则投日本于台湾，岁纳鹿皮三万，求台湾互市也。适日本倭居台湾者新奉天主教，遂许之，筑赤嵌城以居，今安平镇是也。
荷兰既得地，即数数与日本倭构争。倭既染其教，争不胜，尽属东去，愤甚，尽诛其人之习天主教者，并约束琉球。而荷兰据有台湾，置揆一王亦不汉东。
郑芝龙者，闽人也，为日本婿，家于台湾。日本之东归也，芝龙以舟楫人众横于海。大清顺治二年，芝龙自安平奉表降，其子成功逃入海。晚年，率舟师数百艘攻台湾，荷兰寡不敌，遂去而伺于葛留巴。台湾人犹有习其教者，曰「教册」，成功则尽除之。
康熙初，郑克塽降，廷议弃台湾。施琅力争曰：『是资荷兰也』！卒置郡县，功施至今。
附录三日本乞师记（黄宗羲「行朝录」一则）
明季海盗有周崔（鹤）芝者，福清人也。少读书不成，去而为盗于海。其人饶机智，尝往来日本，以善射名，与日本之萨摩岛主结为父子。日本三十六岛，每岛各有王统之。其所谓东京者，乃国主也；国主曰京主，拥虚位而已。一国之权，则大将军掌之；其三十六国王，则如诸侯之职。萨摩王于诸岛为最强，王与大将军为首尾。崔（鹤）芝既熟日本，故在海中无不如意。久之招抚，以黄华关把总稽察商舶。
乙酉秋，唐王隆武加水军都督，副黄斌卿驻舟山。其冬，崔（鹤）芝遣人至萨摩岛，诉中国丧乱，愿假一旅，以齐之存卫、秦之存楚故事望之。将军慨然约明年四月发兵三万，一切战舰、军资、器械，自取其国之余资，供大兵中华数年之用。自长琦岛至东京三千余里，驰道、桥梁、驿递、公馆，重为修辑，以待中国使臣之至。崔（鹤）芝大喜，益备珠玑玩好之物以悦之。参谋林钥舞（一作学舞）为使，期以四月十一东行。钥舞将解维，而斌卿止之曰：『大司马余煌书来曰：「此吴三桂乞师之续也」』！崔（鹤）芝怒而入闽。
福州既破，郑芝龙降。丁亥三月，崔（鹤）芝克海口、镇东二城，遣其义子林皋随安昌王至日本乞师，不得要领而还。
戊子，御史冯京第谋于黄斌卿，偕其弟黄孝卿往日本。至长琦岛，其王不听登陆。始有西洋人为天主教者，入日本作乱于其国。日本勒兵尽诛教人，焚其船于岛口，绝西洋人往来。于中衢置铜板，刻天主教像于其上以践踏之。囊橐有西洋一物，搜得必杀无赦。西洋人复以大舶载炮，来与日本为难，日本拒之，甫退一日，而京第至，故戒严同于外国。京第效包胥故事，于舟中朝服拜哭不已。会东京遣官行部，如中国巡方御史，秃顶坐篮舆，京第因致其血书。萨摩王闻长琦王之拒中国也，曰：『中国丧乱，我不遑恤，而使其使臣哭于我国，我国之耻也』！与大将军言之，议发各岛罪人出师。京第还，日本致洪武钱数十万。盖其国不自鼓铸，但用中国古钱；舟山之用洪武钱由此也。而黄孝卿假商舶留长琦岛。长琦岛多官妓，皆居大宅，无壁落，以绫缦分为私室。当月夜，每室悬各色琉璃灯，诸妓各赛琵琶，中国之所未有。孝卿乐之，忘其为乞师而来者，见轻于其国，其国发师之意益荒矣。
己亥冬，有僧湛微自日本来，为荡胡伯阮进述请兵不允之故，且言『金帛不足以动之。日本最敬佛经，诚得普陀山藏经为贽，则兵必发矣』。进与定西侯张名振上疏监国，以澄波将军阮美为使。王亲赐宴。十一月朔，出普陀。十日至五岛山，与长琦相去一程。是夜大风，黑浪兼天，两红鱼乘空上下，船不知所往。十二日见山，舵工惊曰：『此高丽界也』。转帆而南，又明日乃进长琦。
凡商舶至国，例拨小船稽出入，名曰班船。阮美喻以梵箧乞师。其王闻之大喜。已知船中有湛微者，则大骇。初，湛微之在日本也，长琦岛有三大寺：一曰南京寺，中国北僧居之；一曰福州寺，闽浙广僧居之；一曰日本寺，本国人居之。南京寺住持名如定，颇通文墨，国人重之，湛微拜为师。湛微所能不若师，而狡狯多变。乃之一岛名■〈月斐〉泉者，其岛无中国人往来，不辨诗字之好丑，湛微得妄自高大。恶札村谣，自署金狮子尊者，流传至东京，大将军见之曰：『此必为西洋人之为天主教者潜入吾国』，急捕之。既知其为江西僧，逐之过海。日本不杀大唐僧，有犯法者止于逐，再往则戮及同舟。湛微欲以此举自结于日本。于是阮美始知为其所卖也，遂载经而返。
然日本自宽永享国三十余年，母后承之，其子复辟，改元义明，承平久矣。其人多好诗书、法帖、名画、古奇器。十三经、十七史，异日值千金者，捆载既多，不过一、二百金。故老不见兵革之事。本国且忘，岂能渡海为人复仇乎？即无西洋之事，亦未必能行也。