种蛇入场后的消毒工作包括场地消毒和预防性消毒两方面，其目的都是为了控制病菌的传播和流行。
（1）蛇场消毒的基本原则。由于人工养蛇的历史较短，养殖规模有限，加之各蛇场之间在蛇病的研究方面交流不多，对蛇病发生的状况及防治研究也不够深入。因此，在蛇病防治过程中应坚持“预防为主，防重于治”的基本原则。要对蛇场进行严格管理，健全必要的卫生消毒设施，制定完善的卫生管理制度，规范各环节卫生操作程序，做到严格检疫，定期检查，及早发现病情，及时隔离、诊治和消毒，防止群蛇染发疾病。
（2）蛇场常用的消毒剂。现在面市的消毒药物可谓种类繁多，但那些有刺激性、有异味、有腐蚀性的消毒剂，养蛇场（户）可不能盲目乱用。如烧碱、来苏儿、84消毒剂、福尔马林（甲醛）等。蛇场常用的消毒剂应是广谱杀菌、低毒高效、祛除异味、可饮服的为好，如新洁尔灭、硼酸、百毒杀、高锰酸钾、滴康王、威岛消毒剂和菌毒消毒剂（必须用热水稀释）等。这些消毒剂不仅无异味、无刺激、无毒副作用，而且价格低廉，很适合养蛇场（户）交替使用。
（3）正确使用消毒剂。蛇场消毒防疫少不了用消毒药，但不能长期使用同一品种的消毒药（剂），这样容易引起病原体和细菌的抗药效，使消毒效果明显降低，起不到应有的消毒杀菌作用。科学的使用方法应该是：多选几种常用的消毒药（剂），在蛇场常规消毒时，最好交替轮换使用，这样就不会产生抗药性了。在消毒过程中，一旦发现病蛇，应及时拿出来单独喂养和隔离治疗，以防染及到其他的健康蛇群。若发现天天都有几条病蛇的话，除将症状严重或活动反常的蛇及早取出隔离外，应做一次全场彻底消毒，以防病情进一步扩散和蔓延。对已死病蛇，不要随便丢弃在场内或蛇场周围，应远离蛇场后挖坑深埋。