（1）人口增长和经济增长对环境和资源产生巨大了压力。在人口不断增长的情况下，在贫困环境中挣扎的贫苦农民为了生存，除了开荒种粮以解决吃饭问题，砍伐森林以做饭取暖，向大自然无情索取之外，别无选择。这种选择行为，形成越穷越砍、越砍越穷的恶性循环，带来的只会是生态环境的加速破坏和农村经济发展的停顿。即使在一些富裕地区，由于人们需求水平的不断提高，也往往只顾眼前利益，对自然资源进行掠夺性开发，大量占用耕地，开发山林，以增加财富，而忽视土地及其他自然生态系统的良性循环。
（2）产业和产品结构的不合理导致严重的结构性污染。乡镇企业迅速发展，无疑给农村经济注入了活力。但由于资金短缺，急于上马，对于产业和产品不作或很少作选择，使许多污染严重、难于治理的产业和产品纷纷上马。加之乡镇企业门类多，生产技术、设备落后，污染物排放量大，污染物的成分复杂，污染处理设施没有或严重滞后，处理率低，现有处理设施运转也不正常，对生态环境产生综合性危害。
（3）不合理开发自然资源，导致农业生态环境严重破坏。农业生态环境的恶化，大多表现在土地资源被破坏。人口压力引起对土地需求的剧增以及对土地资源过度利用。人们为了发展乡镇企业，不合理地占用大量耕地，进行生产和排污；为了提高产量，不合理地使用化肥、农药、农膜，造成污染；为了提高生产水平，大量占用耕地建设新房；为了发展经济，搞开发区工业园的过程中，无所顾忌地“围”、“圈”土地，另外，修路等公用设施占地也很多。这样一来，不仅土地大量减少，而且破坏了包括土地资源在内的自然资源和生态环境，打破了土地生态系统长期存在的良性循环。再加上植被的破坏，特别是森林的砍伐，草原的开垦，使本来就很脆弱的农村和农业生态环境遭受严重破坏。
此外，环境法律意识淡薄，也是造成农村环境破坏的一个重要原因。