新的军队编制中，庄少游亲自出任三军统帅，并成立了军政部，乐进这员允文允武的能将出任军政部部长，军政部下辖陆军司、水军司、参谋司、后勤司，共四个二级单位。
乐进兼任任陆军司主事、太史慈副之；墨水任水军司主事；田丰、荀攸、华歆一正两副参谋司主事；国渊、墨铁暂代一正一副后勤司主事，一个管粮食，一个管军备。
其中乐进军衔中将，分管步兵，麾下将士一万六千人，编成两个师，步兵第一师和步兵第二师。第一师主要为洛阳老兵，下辖三个旅，暂编8000人，师都统由乐进兼任；第二师为辽南旧部和在洛阳招募的新兵以及濮阳城乔瑁手下的一千余人，下辖三个旅，暂编8000人，师都统也由乐进兼任，庄少游的老部将张三任副都统，军衔上校，目前张三正在辽南驻防。
太史慈军衔少将，分管骑兵，麾下八千铁骑，编为三个旅，番号为骑兵第一师，太史慈兼任师都统，庄少游的老部将秦岭任副都统，军衔上校。
墨水分管水师，军衔少将，下辖两个水师大队，第一大队8000人，下辖四个中队，有五桅战船四艘，四桅战船两艘，三桅战船一艘，编制基本健全，但战船不足，墨水兼任第一大队大队长。第二大队主要为大野泽水贼，暂编6000人，下辖三个中队，四桅战船六艘，小型战船八百艘！扈三娘任大队长，军衔准将，墨十三任副大队长，军衔上校！
墨十三很痛苦，无论在家里，还是军队里，都被扈三娘领导，看来这辈子是很难翻身了！至于当初叫嚣着去倭国嫖一把的事情只能无限期延后。
吸取晋代九品中正制之优点，将官员分为九品，并与军衔相对应。比如，最低级的准尉品级定为从九品，而上将则定为正二品！军衔越高，品级跳跃越大。
上将 正二品
中将 正三品
少将 正四品
准将 从四品
上校 正五品
中校 正六品
少校 正七品
大尉 从七品
上尉 正八品
中尉 从八品
少尉 正九品
准尉 从九品
俸禄则与品级挂钩，也就是军政俸禄是一个体系，在制定俸禄的时候庄少游的确是煞费思量，太高了不行，太低了也不行，大汉朝廷给公卿的俸禄可是很高的，而且贫富差距巨大，万石的三公月俸为350斛粟，年俸肯定超过百万钱！而最低级的佐史月俸8斛粟，年俸不足三万钱，连养活一家三口都很勉强，特别是粮价暴涨的现在，俸禄基本都是浮云！
而大汉朝廷采取过一些对策，将俸禄发一半钱，发一半粟，可以有效调节粮价波动带来的冲击，但是如今的大汉朝听连洛阳的公卿的俸禄都难以为继，地方官员俸禄早就断了二十年之久！自己动手，丰衣足食！
基于对底层官员的照顾，还有对高级官员的压制，庄少游绞尽脑汁，才设计出一套勉强能够平衡各方利益的俸禄体系，这一体系，也是按照品级来定。
正一品 月俸30000钱
从一品 月俸25000钱
正二品 月俸22000钱
从二品 月俸20000钱
正三品 月俸18000钱
从三品 月俸15000钱
正四品 月俸12000钱
从四品 月俸10000钱
正五品 月俸9000钱
从五品 月俸8000钱
正六品 月俸7000钱
从六品 月俸6000钱
正七品 月俸5000钱
从七品 月俸4000钱
正八品 月俸3500钱
从八品 月俸3000钱
正九品 月俸2500钱
从九品 月俸2000钱
最高级的正一品的俸禄是最低级从九品的俸禄的15倍，较之汉制的44倍，可谓是缩小不少！同时，对从七品及以下官员，开放官方粮仓，可以根据家中人口数量，以市价一半的价格限量购买口粮！
辽南地区现在的粮价已经跌到250钱一斛以下，半价才125钱，一个从九品官员的俸禄可以让一家老小过得十分惬意！就算濮阳城内的粮价较高，达到500钱一斛，那是因为中原地产去缺粮的缘故，从九品的官员也能养活一家老小三代七八口子人吃饭。
军中的各级将领都有相应的品级，因此按级发放俸禄即可！而且作战还有各种军功奖励！而普通士兵没有品级，因而饷银体系单列，根据士兵等级不同，发放的饷银也是各不相同。
五级兵 月俸2000钱
四级兵 月俸1500钱
****兵 月俸1000钱
二级兵 月俸600钱
一级兵 月俸300钱
所有士兵初始等级都为一级，也就是大家都处在同一个起跑线上，根据战功的提升，可以不断升级，最高五级士兵！而且，五级士兵不是终点，而是新的起点！五级士兵可以获得去初级军官学校培训的资格，顺利毕业可以升级准尉！也就是入门级将领。
所以，尽管饷银比原来足足低了两倍，但只要升级到****兵，饷银就会翻三倍，更重要的是，这些普通的士兵也有了奔头！五级兵虽然难升，但可以去初级军官学校培训，毕业就能变成准尉！
这是一个极大的诱惑，特别是在等级制度森严的年代，社会上下层之间基本是不流动的，而这一套制度，则给予了普通士兵这份希望，只要你努力，多立战功，再通过各级培训，士兵也能成为将军！
庄少游麾下士兵的家属全部都在辽南，辽南物价低，小日子过得好着呢！饷银虽然少了一些，但军队的伙食还是不错的，吃得饱吃得好！只要不像墨十三那样整天去嫖赌，饷银完全可以省下来补贴家用。和中原那些依旧挣扎在贫困线上的普通百姓相比，依旧好很多倍！
而且战功可以用来兑换金钱，或者用来升级，杀死一个敌人并取得其首级，可以直接兑换一万钱的奖励，也可以将自身升级为二级兵，如何选择，全凭个人意愿。
军制改革的命令已经颁布，从反映来看效果还算不错，基层士兵十分高兴，百夫长也很兴奋，但是中级将领如千夫长则是有人欢喜有人忧！
因为对普通士兵来说，生活本来就是上战场砍人，活着，拿饷银、赏钱，然后吃饭，如此往复熏循环，直至战死。但是现在一切变得不同了，老子也******能当将军了！虽然很遥远，但不是没有可能！王侯将相宁有种乎？！下次大战一定要好好砍人！争取先升一级！
百夫长们之所以不淡定，那是因为大部分人的级别基本不变，只不过换了个名字，然后还多了两个副手，但多了营级单位，也就是说每五个百夫长就会有一个人升官！显然，每个人都希望自己就是那五分之一！
而千夫长们则是不同了，以前也算是军中一号人物，现在倒好，一改革，千夫长立刻变得不尴不尬起来，旅帅虽好，但竞争激烈，只有威望高，人缘好，能力强的人才能坐上旅帅的宝座，差点的就只能做副帅。但按照惯例，副手基本就是摆设，没什么实权！所以，有的千夫长干脆，一狠心，下去竞争营都尉了！结果引得下面的百夫长们强烈鄙视！
最后，还是乐进和太史慈等人亲自出面调停，才勉强安抚住那些千夫长，步兵和骑兵每个师暂时都有三个旅，三正六副，放下八个千夫长自然是绰有余裕，乐进承诺，很快就要再扩编一个旅，而新的旅帅将从六个副帅中挑选最优秀的来担任，并且，师部的副都统还暂缺，八人将不分正副，具有同等机会，但仅此一次！
一连折腾了三天，才总算将各军的人事变动工作基本完成，但这其中也反映出不少的问题，最突出的问题就是各级指挥将领的缺乏，包括师部的参谋。
比如，第一骑兵师只有一个副都统秦岭，还缺一个，而步兵方面更是人才匮乏，乐进一人兼任两个师的都统，四个副都统中只有张三一人，还缺三个！
对于这一点，庄少游的办法是这样的，提拔一批，招募一批，培养一批！
提拔一批，就是从现有的旅帅和副帅中选出合适的人选，出任副都统，以减轻乐进的工作量；招募一批，就是在濮阳继续招募高级人才，只要才能合适，立刻可以出任副都统！甚至都统！而衡量是否合适的标准由庄少游亲自判断。
至于培养一批，则是着手建立陆军学院和水军学院，地点就选在濮阳和辽南！主要用于培养中下级指挥人员。本来庄少游想在两个学院前面加上皇家二字，但是想想还是算了，低调！低调！咱现在还是正八经儿的大汉臣子呢！
军制改革了，内政方面也要相应的调整，所以庄少游还成立了行政部，专门管理除军政以外的事物，国渊出任行政部部长，品级正三品，与乐进品级相同，目的就是实现军政与民政的分治，并宣告二者具有同等地位。墨家巨子墨石出任副部长，品级从三品。
原辽南行政厅下辖各二级单位升格为司，司主事品级为正四品，取消民政司，锻造厂和造船厂划给军政部后勤司，这么一来国渊、墨铁、墨水三人身兼数职，工作量繁重，但目前人才匮乏，也只能暂且将就一番，改革后的行政部包括：
农耕司 主事墨土
商贸司 主事周天，副主事荣华
情报司 主事吴良
科技司 主事墨巧（玻璃）
财政司 主事墨眉（大老婆）
锻造厂和造船厂现阶段的主要任务就是供应军需，因此暂且划给军政部，日后再行调整。取消民政司的原因是原先只有辽南一地，而现在控制的地盘多了一些，而且很分散，并且以后会更多，所以民政工作还是下放给地方来处理的合适！
麾下地盘划分为三个郡，辽南郡、东郡、巨野郡，巨野郡就是原来的大野泽地区，郡设太守一职，品级也是正四品，与各司主事同级。东郡太守依旧是乔瑁，辽南郡太守国渊兼任，反正国渊就是一头老黄牛，勤勤恳恳的工作，一丝不苟，而且对辽南又极其熟悉，感情深厚。巨野郡的太守由扈三娘暂时兼任，庄少游亲自主抓，具体工作由扈三娘执行，实现野人治野！
三大郡下辖的各县、镇也进行了相应的调整，辽南郡的各个镇直接升格为县，县令品级正七品！