清朝统治者得知中国同盟会在日本成立，总部设在东京，并且选举孙中山先生为总理的消息感到惊慌不安，忙与日本当局勾结，设法压制留日学生的革命活动。
光绪三十一年七月二十五日（1905年8月25日），清廷驻日大使兼留学生总监督杨枢致函外务部称：“逆党孙文（孙中山——引者注）来自英国，屡在东京开会，登台演说，借以鼓动学生，而学生之赴会听讲者约千余人甚为可惧。枢窃欲设法禁阻，惟孙文系国事犯，不能公然照会日本外务省代为惩办，不得已以私情往晤珍田（日本官员——引者注），谆托密派巡捕，随时踪迹，窥其举动。”
同年11月2日，日本国文部发布《收容清国人留学之公私学校章程》，其中第9条规定：“凡受选定之公私立学校，应令清国学生在寄宿舍或在该校所监督之下宿等处居住，受为约束。”这里所称的“受为约束”，是指监督留日学生的饮食起居，限制他们一切秘密或公开的集会活动。清朝统治者和日本当局的勾结行动激起广大留日学生的极度愤慨，认为这是日本当局对中国学生的人格侮辱。于是，中国留日学生总会号召各校留日学生共同罢课，并以集体回国的行动表示严正抗议。
李四光积极响应总会号召，正当准备回国的时候，接到孙中山先生发来的紧急电报。电文不赞成留日学生全体回国，以防同盟会员学生回到国内遭到清朝政府的一网打尽。因此，各校留日学生坚持统一罢课，要求日本当局尊重中国学生的人身自由，承认中国留日学生会馆的合法权利。
日本当局基于中国留学生全体罢课的压力以及国内外正义舆论的谴责。不得不向中国学生妥协，答应中国留日学生总会提出的各项条件。此后，各校中国学生陆续复课。
1910年7月下旬，李四光胜利结束了7年的日本留学生活，安全回到祖国。