公元1663年，黄宗羲的名著《明夷待访录》问世。在书中，他指斥君主专制制度，提出了“天下之治乱，不在一姓之兴亡，而在万民之忧乐”的思想。书中字里行间闪烁着民主思想的光辉，以至于该书后来成为晚清戊戌变法中维新派的有力思想武器。《明夷待访录》还提出了“工商皆本”的先进思想。黄宗羲敢于向传统的封建思想挑战，这在当时是需要相当大的魄力和远见卓识的。
公元1665年，黄宗羲收徒讲学，后来成为著名学者的万斯大、万斯同等人都是他的学生。公元1667年，他恢复了他的老师刘宗周创办的证人书院。黄宗羲讲学注意教给学生做学问的门径和方法，强调读书必切实用。除了经、史、子、集之外，历法、天文等自然科学也是他的教学内容。他深受学生的欢迎，在20多年的时间里，有100多人拜他为师，他已是一名学生满天下的学者了。
公元1678年，康熙为了笼络汉族地主，开博学鸿儒科取仕，命令三品以上的中央和地方官吏推荐人才。掌院学士叶方蔼向康熙推荐了黄宗羲，他婉言辞谢了。两年后，清政府聘请黄宗羲任《明史》编修的顾问，他以气节为重，再次力辞。康熙没有勉强，要求他把所写的有关历史方面的著作全都抄送入京。黄宗羲虽然没有直接参予《明史》的修撰，但《明史》的修成也凝聚了他的许多心血，他随时准备回答裁定对疑难问题的垂询。比如《历志》，虽不是他执笔，却是经他的审阅才定稿的。公元1676年，他完成了另一重要著作《明濡学案》，把明代200多位学者的著作系统排比，阐明每个学者的学术渊源、学说宗旨及演变，评论公允、分析深入，这在中国历史上是首创。晚年，他又完成了《宋元学案》，使700年间儒苑门户一目了然，这在中国学术史上是一个杰出的贡献。他晚年仍然非常勤奋，自持十分严格，每天读书不完成规定的卷数绝不休息。他以84岁的高龄，编撰了482卷的《明文海》这部巨著。
公元1695年，黄宗羲与世长辞。死前留下遗嘱，要求家人在他死后“于次日安葬，敛以时服，一被一褥，安放石床，不用棺梆，不作佛事，不做七七，凡鼓吹巫觋铭旌纸幡纸钱一概不用”。这是对佛教唯心主义思想最大的轻蔑，也是他唯物主义认识观的彻底表现。他以特有的铮铮风骨、昂扬的战斗性格、博大精深的学术思想为自己的一生做了很好的总结。
●顾炎武终生抗清
顾炎武，原名绛，字忠清，明亡后改名炎武，字宁人。他是明末清初著名的思想家、史学家和语言学家。顾炎武出身江南大族，从小喜欢读《资治通鉴》《史记》和《孙子兵法》等书，十分关心时事。后来参加明朝的科举，没有考中，就放弃仕途，开始通读历代历史典籍，研究全国各地的地方志和历代名人奏章，并着手编写一本重要的历史地理著作《天下郡国利病书》。正当顾炎武用心治学的时候，明朝灭亡，清兵南下，他的亲人也相继去世。顾炎武隐姓改名，在长江南北一带奔走，想组织一支抗清义军，但没能成功。后来，顾炎武在江南呆不下去了，就决心到北方去游历。
顾炎武来到北方，一来想考察各地的地理形势、风俗民情，二来也想找机会结交一些志同道合的朋友，进行抗清活动。他在长途跋涉的艰苦环境里，并没有放弃学术研究。遇到关塞险要的地方，他就访问当地的人民，了解那里的风土人情，如果跟他在书本上读到的不一样，就拿出书本核对。顾炎武从45岁起，用了20多年时间，在山东、山西、河北等地来回奔走。他还曾经和朋友一起，在雁北开垦荒地。到了晚年，顾炎武才在陕西华阴定居下来。
顾炎武从小读书有个习惯，有一点心得就记下来，后来如果发现有错误就随时修改，发现跟古人议论重复的就删掉。这样日积月累，再加上他在调查访问中得到的材料，编成一本涉及政治、经济、历史、地理、文艺等多个领域，内容极其广泛的书，叫做《日知录》。这是一部被公认为极有学术价值的著作。在《日知录》里，顾炎武写了这样一段精辟的话：“保天下者，匹夫之贱，与有责耳矣！”意思是社会的道德风气败坏，就是亡天下，为了保天下不亡，每一个地位低微的普通人，都应负起责任。
公元1682年年初，年迈体弱的顾炎武访友准备回归华阴时，不幸落马坠地，次日溘然长逝于山西曲沃顾炎武的道德言行、学问文章及终生抗清的思想对后世产生了不可磨灭的影响。
●顺治帝册封达赖
达赖五世罗卜藏嘉木错于公元1637年嗣位。清军入关后，屡次派人前往西藏，延请达赖。公元1652年年底，达赖五世至京师，在南苑谒见顺治帝，清廷以隆重礼遇接见了达赖。次年正月十一和十六，顺治帝先后两次在太和殿宴请达赖五世，并赐予大量的金器、彩缎、鞍马等物。二月二十，达赖五世请辞返回西藏。
四月二十二，顺治帝派礼部尚书觉罗郎球、理藩院侍郎席达礼等把封达赖五世为达赖喇嘛的金册、金印（文用满、藏、汉三种文字）送给达赖，封达赖五世为“西天大善自在佛，所领天下释教普通瓦赫喇怛喇达赖刺嘛”。从此，达赖正式得到“达赖喇嘛”的称号。承认了达赖在西藏的政治、宗教地位，清廷加强了对西藏的统治。
●雄才大略康熙帝
顺治去世前，让康熙即位，并让索尼、苏克萨哈、一遏必隆、鳌拜四位大臣辅政。康熙登上皇位后，每天不是读书就是游玩，朝廷大权都掌握在辅政大臣手里。在四个辅政大臣中，鳌拜最喜欢弄权，有极大的政治野心。康熙渐渐长大，也渐渐懂事，对有些事情有自己的看法。鳌拜决定了的事，要是康熙不同意，他就终日在朝廷上吵闹，非逼得康熙点头不可。哪个大臣提出异议，他就寻个借口杀掉他。
一转眼，康熙14岁了。按照规定，他可以亲自管理国家大事了。这时候，索尼已经死去了；苏克萨哈因为跟鳌拜有矛盾，被鳌拜诬陷为反对康熙亲政，置于死地；遏必隆则处处附和鳌拜，听从他的支配。现在，康熙已经宣布亲政了，鳌拜本来应该把权力交给康熙，可是他不但不这样做，反而比以前更专横了。
康熙想制伏鳌拜，但他知道鳌拜长期掌握朝廷大权，很难对付，稍有不慎，就会走露风声、打草惊蛇。他想出了一个办法。为了对付鳌拜，康熙挑选了上百名十几岁的少年侍卫，在宫中练习摔跤。与此同时，还不断地派出探子，探听鳌拜的动静，准备采取对策。
一天，康熙得知鳌拜要进宫奏事，就把那些每天跟他摔跤的少年侍卫叫到身边，吩咐了一番。过了一会儿，鳌拜仍和往常一样，大摇大摆地走进皇宫。康熙见了鳌拜骄横的态度，十分愤恨，便厉声说：“鳌拜！你可知罪？”鳌拜冷笑一声，还是像往常那样放肆地挥动手臂说：“我鳌拜奉先皇命令辅佐陛下8年，教会陛下如何管理国家，我有什么罪？”康熙历数鳌拜结党营私、图谋不轨等罪状，鳌拜不禁恼羞成怒，他大声叫嚷说：“说我犯了大罪，拿出证据来！”康熙见时机成熟，便大喝一声：“来人哪！快把这奸贼给我拿下了！”话音刚落，立即从四面八方冲出来许多少年侍卫。鳌拜是久经沙场的猛将，见冲上来的都是赤手空拳的小孩子，并没有放在心上，哪知这些少年身手不凡，不一会儿鳌拜便被捆得结结实实，动弹不了。康熙下令把鳌拜关起来，给被他打击和害死的大臣平了反，鳌拜后来死在狱中。
清军入关以后，遭到全国各族人民的顽强抵抗。于是，清廷对汉族官员采取分化瓦解政策，对投降的汉族官员赏以高官厚禄。“藩”是指封建王朝时期王的属地，“三藩”是指平西王吴三桂、平南王尚可喜、靖南王耿精忠。这三人原是明朝边将，投降清军后，先后为清廷南征北战，为清廷立下汗马功劳。清廷在北京建立政权后，他们被封为王，享有很多特权。平西王吴三桂驻守云南、贵州，平南王尚可喜驻守广东，靖南王耿精忠驻守福建。三落不仅拥有独立的军队，还享有独立的财权。除朝廷每年拨给两千多万两饷银外，朝廷还不能征收三藩所在省的财政收入，户部也不能稽核他们的财政开支。三藩甚至掌握独立的官员任免权。三藩中以吴三桂势力最大。
公元1673年，尚可喜上书朝廷请求告老回辽东老家，同时请求让他的儿子尚之信继承王位。康熙帝立即让尚可喜还乡，但不准许他儿子继位，打算趁此机会让他们撤藩回原籍。吴三桂和耿精忠听到这个信息后坐立不安，为了试探皇帝的真实意图，两人分别上书，要求撤藩回乡。奏章送达朝廷后，整个朝廷议论纷纷。但康熙帝早已胸有成竹，特诏批准，他说：“吴三桂蓄谋已久，不赶快解决，必将成为大患。撤藩他们要反，不撤藩他们也要反，反正他们迟早都要反，我们不如先发制人！”吴三桂弄巧成拙，恼羞成怒，表面上恭恭敬敬奉诏行事，暗地里准备造反。
公元1673年年底，吴三桂自称“天下都招讨兵马大元帅”，要“伐暴救民，顺天应人”，公开打起了反清复明的旗号。次年四月，耿精忠反叛。公元1676年，尚之信接受吴三桂册奉的“招讨大将军”封号，参加反叛。三藩作乱，人多面广，举国震惊。朝廷中的一些官员甚至做了逃难的准备。康熙帝却表示对三藩要坚决镇压，绝不手软，并决定以打击吴三桂为重点。公元1678年，吴三桂见大势已去，终于抛开“反清复明”的假面具，在湖南衡山祭天称帝，国号大周，建元昭武。下令改衡州为定天府，建朝房百余间，开始了荒淫无度的帝王生活。可惜好景不长，不到五个月，吴三桂一病不起。吴三桂死后，吴三桂13岁的孙子从云南来衡州继位，改元洪化。在清军的围攻下，吴三桂小朝廷不久即放弃衡州，退回云南，最后逃至昆明。公元1680年，康熙帝令清军分三路进军云贵。次年十月，小朝廷的南门守将开门迎降，吴三桂的孙子服毒自尽。历时8年的三藩之乱终于平息了。
●康熙三征噶尔丹
噶尔丹是蒙古族准噶尔部的首领，自从他统治准噶尔部以后，先兼并了漠西蒙古的其他部落，又向东进攻漠北蒙古。漠北蒙古被攻破后，几十万的漠北蒙古人逃到漠南，哀求清朝给予保护。康熙派使者来到噶尔丹那里，要他将侵占的地方交还给漠北蒙古。噶尔丹的幕后有沙俄政府唆使策划，他根本不理睬康熙的劝说，不但不肯退兵，还大举进犯漠南，气焰十分嚣张。康熙见谈判无望，决定亲征噶尔丹。
公元1690年，康熙兵分两路出击噶尔丹。左路由抚远大将军福全率领，出击古北口，右路由安北大将军常宁率领，出击喜峰口，康熙帝亲自带兵在后面指挥。一阵激战，噶尔丹带着残兵败将逃到漠北去了。公元1694年，康熙约噶尔丹会见，订立盟约。噶尔丹不仅不来，反而派人到漠南煽动叛乱，并扬言沙俄将支援六万鸟枪兵，对付清军。面对噶尔丹的阴谋，公元1696年，康熙第二次亲征，分三路出击：黑龙江将军萨布素从东路进兵；大将军费扬古率陕西、甘肃大军，从西路出击，截击噶尔丹的后路；康熙帝亲自带中路军，从独石口出发。一场激战后，噶尔丹带着几十名骑兵仓皇逃命。
噶尔丹叛军经过两次大战，所剩无几。康熙劝噶尔丹投降，但他顽抗到底。隔了一年，康熙又率兵渡过黄河亲征。这时，叛军的将领听说清军又来时，纷纷投降。噶尔丹走投无路，服毒自杀。自此，清朝重新控制了阿尔泰山区以东的地区。
●雍正设谋夺皇位
康熙共有35个儿子，长大成人的有24个。在这24位皇子中，康熙最喜欢皇后所生的二皇子胤，康熙便立他为太子。后来，康熙一气之下废了胤礽。过了一段时间，康熙又重立胤礽为太子。不久，康熙又下令废了胤礽。康熙为立太子之事很苦恼，思前想后，他决定把皇位传给十四皇子胤禵，胤禵和四皇子胤禛是一母所生。
胤禵知识渊博，为人忠厚，也很正直。那时，允禵被派到甘肃，作为抚远大将军准备征讨准噶尔。康熙决定立胤禵为太子，便立即下令，命隆科多召他回京。康熙帝知道自己已69岁，而且身体又不好，所以他想立即立胤禵为太子，以免其他皇子再为此事争得头破血流。隆科多手拿密诏，却迟迟不发，而是找到胤禛，隆科多早已被胤禛买通了。二人经过商议，决定篡改密诏。原来，康熙下的密诏是：“传位十四皇子”。隆科多和胤禛篡改密诏后，将密诏藏了起来。这时候，康熙已卧床不起。隆科多日夜守护康熙，不让其他皇子随意进入。
公元1722年年底，康熙的病越来越重了，经常昏迷。这一天，他稍稍清醒点，便想起十四皇子，知道自己恐怕见不到十四皇子了，就想留下遗旨，让众位皇子做一个见证，也可以让他们退出皇位之争，便强打精神，说：“召诸皇子晋见！”可隆科多故意装作听错，高喊道：“皇帝宣四皇子晋见！”康熙本想解释，但已经没有气力说话了，他意识到胤禛和隆科多已串通好了，一气之下，康熙离开了人世。
隆科多一见康熙驾崩，立即让其他皇子进来。隆科多见诸皇子哭得十分伤心，便清清嗓音，高声说：“诸位皇子，节哀，听我宣读圣上遗诏！”大家听说父亲有遗诏，都止住哭声，尤其是想夺取皇位的几位都竖起了耳朵，他们最关心皇位的事了。隆科多从袖中拿出早已篡改好的圣旨，读道：“联决定传位于四皇子，着继朕登基。”原来隆科多把“十”字上边加了一横，下边又加了一个勾，便成了“于”字。
三皇子胤祉和胤礽是一母所生，但他为人厚道，对皇位也不感兴趣，一听说父皇有遗旨，让四皇子继位，第一个跪倒叩拜。其他的皇子心里虽有所不服，也没有办法，只好跟着跪拜。胤禛就这样夺取了皇位，改元为雍正，是为雍正帝。
●清朝大兴文字狱
清朝的文字狱十分严重，而且都非常荒谬。这些案件完全是由写文章引起的，人们就管它叫“文字狱”。文字狱直接导致了清朝的政治局面和学术思想越来越僵硬。知识分子为了自保，都把精力投入到了无风险的古籍研究之中，导致清朝在科技、思想、文化上与中国其他时代相比有了明显退步。社会发展如一潭死水，毫无生气。
公元1711年，有人告发翰林官戴名世在自己的文集《南山集》中对明朝政权表示了同情态度，又用了南明永历帝的年号。康熙就下令把戴名世打进大牢，判处死刑。这个案件牵连到他的亲友和刻印他文集的人，达300多人。