胃肠炎是胃肠黏膜及其深层组织的出血性或坏死性炎症。其临床表现以严重的胃肠功能障碍和不同程度的自体中毒为特征。
在饲养管理不当、饲料质量不良(如采食大量的冰冻、发霉饲料，饲草、饲料中混进具有刺激性的化肥，如过磷酸钙、硝铵等)、饮用不清洁的冰冻水等情况下，强烈的刺激作用可导致胃肠炎；服用过量的蓖麻油、芦荟、芒硝等也可致病；长途运输及不适当地使用广谱抗菌素，造成肠道菌群失调，也易引起胃肠炎；某些传染病、寄生虫病或内科病（如羊副结核、巴氏杆菌病、羊快疫、肠毒血症、炭疽、羔羊大肠杆菌病等），常引起继发性胃肠炎；圈舍潮湿，卫生不良，冬春季节羊体质乏弱，营养不良，以及投服驱虫药剂量偏大，也是该病发生的原因之一。
胃肠炎的主要症状是腹泻。粪便如猪粪，混有精料颗粒，随后拉稀。严重者，粪便中混有血液、假膜、脓液。病至后期，经常可见到肛门括约肌失禁，甚至直肠脱出。体况恶化，精神不振，食欲消失，反刍停止，出现呻吟，腹痛不安，喜欢卧地。
对严重腹泻病羊，可用抗菌素及磺胺类药物，另外配合收敛剂，如鞣酸蛋白或次硝酸铋(每只2～5克，内服)。为防止胃肠内容物腐败，可选用内服0.1%高锰酸钾250～500毫升，每天1～2次；或灌入淀粉浆，内加磺胺脒和碳酸钠各2～3克。为吸附肠内有毒物质，可内服药用炭20～40克。
失水严重时，可用葡萄糖盐水或复方氯化钠溶液500～1000毫升，静脉注射；也可用苦参150克，研为细末，加水冲开一次投服，每天1剂，2～3剂即可。
急性胃肠炎可用白头翁12克、陈皮9克、黄连2克、黄芩3克、大黄3克、山栀3克、茯苓6克、泽泻6克、内金9克、木香2克、山楂6克，水煎，1次内服。