黑夜，杀手们的天下。随着一声尖叫，一个黑衣少年以极快的速度窜了出来，时不时望了望后面，显得沉稳并不慌张。
他叫凌天，今年22岁，是一个孤儿。他一出生便没有父母，他憎恨老天的不公，他狠这世界的高低，他狠这世界的一切！就是这股信念支持他到现在，使他完成比其他杀手更高强度的训练！于是，SSS级杀手，凌天诞生了！对他来说，杀人只是一件踩死一只蚂蚁的事情，拿人钱财，为他做事，这是不变的真理！今天他的任务就是杀死背叛组织，并拿着大多数杀手资料的雇主全家！
凌天刚刚杀死那个雇主和他的妻子，准备撤离的时候不幸被发现，现在他正准备逃跑！
忽然，他发现前面有个人影，凌天手上突然多出了一枚银针，银针上发出点点银光，显得有一丝寒意。直到那个人影出来后，凌天停了下来。那个人影竟然是个小女孩！凌天非常清楚，那个小女孩就是雇主的女儿，也是目标之一！但，凌天做杀手的第一天起就发誓，不杀孩子！因为他知道失去父母的孤独，所以他准备无视她，立刻逃跑！
“找到了！他在这！”随着这一声嘶吼，很快凌天的身后出现了几个佣兵，手里的枪对准了凌天和他后面的小女孩！
凌天一怒道：“你们不是要杀我吗？对准一个手无寸铁的孩子干什么？！”
这几个佣兵什么也没说，因为他们的任务就是要铲除这个杀手，至于其他的。。有上面帮他们顶着，所以他们不用担心，对准凌天就是几枪！
凌天二话不说，立刻帮小女孩挡住子弹。过了，几秒他感觉眼前一片模糊，倒地不起。。
终于，结束了啊。。
但是凌天感觉身上一点疼痛感都没有，睁开眼一看，发现自己已经不在那个地方了！现在凌天浮在空中，四周都有蓝色线条在游走。忽然，他的面前出现了一个身高高达50米的巨人！那个巨人由红、银、灰三色组成，胸前的淡蓝色标志“X”散发着微微蓝光，巨人头慢慢的转向了他道：“作为一个杀手，却为了一个小女孩而牺牲。你的精神真令我感动啊！”
“奥特曼。。艾克斯？你是艾克斯奥特曼！”凌天望着艾克斯道。
凌天小时候因为十分孤独，经常看奥特曼！即使到了今天也一样，所以他认识艾克斯并不奇怪，他也算个奥特曼专家了！
艾克斯又道：“我为了追击企图毁灭银河系的可怕敌人而引起奥特·耀斑爆发，现在火花人偶已经实体化引发了灾难。你为了救小女孩而牺牲自己的精神令我感动，你是否可以和我融合拯救世界？也当是为你之前的罪恶赎罪。”
凌天想了想道：“我。。以前只有杀戮，的确做错了太多。现在想想，那些死去的都是人，他们也有亲人，现在我应该守护他们了。。”
“那好，来吧！”艾克斯将右手伸向凌天，凌天也将右手伸向艾克斯，两只手合在一起发出强烈的光将两人融合成一个光球并消失与空气中。。
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太阳奥特·耀斑的爆发，使得沉睡在世界各地谜之人偶，火花人偶出现实体化并出现暴乱，为了对抗不断出现的怪兽和宇宙人，世界各国组织了一支特殊防卫部队，那就是xio。。
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忽然一道光球落地，光球渐渐消失后，凌天也正式来到艾克斯的世界！
“这就是奥特·耀斑爆发的地球，一切的开始。”
凌天望了望周围道：“艾克斯你在哪里？”
“我在你的肩膀这里，因为没有合适的容器，所以我只能以火花人偶的姿态存在。你现在必须得找一个合适的容器让我在地球上活动！”凌天肩膀上的艾克斯道。
“这简单，我现在就去加入xio，拿到那个终端就行。”
说罢，凌天很快找到xio的基地，并报名参加xio，因为重生之前是一个杀手，所以他的各项考核对他来说都是小菜一碟，顺利成章的就加入了xio。
“欢迎新队员！”神木队长高兴的拍着手道，其他队员也跟着配笑。
“我叫神木正太郎，xio队长。欢迎新人加入！”神木队长道。
“我是橘小百合，副队长，欢迎你！”橘副队长微笑着说。
“我叫山濑明日奈，请多指教！”明日奈走过来和凌天握了握手道。
“我是风间渡，欢迎加入！”阿渡一巴掌拍在凌天肩膀上，还好凌天是“练过的”，不然他都承受不了啊！
“我是贵岛隼人，欢迎！”
“我是山岸武，欢迎加入！”
“我是松戸千晶，恭喜你加入xio！”
凌天笑了笑道：“我叫凌天，以后请多多指教！”
“哦来新人了，我请你吃优乳酪怎么样？”梵顿星人走过来道。
凌天望了望梵顿星人道：“梵顿星人博尔曼博士？”
博尔曼看了看凌天道：“没想到你认得我！过奖过奖。”
“我听说过，对了还有大空大地队员，两位天才发明家三日月守先生及高田琉依小姐呢？”
“他们去山里进行电子怪兽的实验了，所以不在。”橘副队长笑了笑对凌天道。
忽然警报声一响，千晶拨动了了几下电脑道：“现在正在区域S2-A区域，地底有巨大的热源在移动。”
神木队长道：“阿渡，隼人立刻出动！”
“明日奈你和实验队伍在陆地调查，凌天你第一天上任经验不足就和明日奈一起去！”橘副队长对凌天道。
“明白！”
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“大地队员？大地快回答啊！你在做什么？”明日奈一边开着车，一边呼叫大地。凌天则偷偷的把艾克斯的火花人偶融入xio终端，终端立刻变成了金色，屏幕也出现了艾克斯的图像。
“明日奈刹车！”一道声音迫使明日奈一个急刹车，凌天还在窃喜，忽然被那阵急刹车撞了头。。
“明日奈你没事吗？这位是？”大地跑了过来望着两人道
凌天望着大地笑了笑道：“我叫凌天，是xio新队员，你是大地队员吧！请多指教。”
忽然地底一头怪兽窜了出来，那就是迪玛珈！
“出现新的怪兽，G形态，身高大约五十米！”大地对着终端道。
迪玛珈也注意道他们，一发熔岩弹打了过去，正巧把三人打飞，不同与剧情的是大地和明日奈都晕了，只剩下凌天。
“凌天，融合吧！”艾克斯在终端里对凌天说。
凌天点点头道：“OK，融合！”
凌天将艾克斯终端伸向前方，一手按下艾克斯终端顶上的按钮使艾克斯终端的双翼变形为X形，并弹出艾克斯的人偶，凌天抓住人偶并将艾克斯人偶的脚底接触终端的解读口。
正在与艾克斯奥特曼融合。。
凌天高举艾克斯终端道：“艾克斯！”
一道光闪过，艾克斯奥特曼落地，周围游走着蓝色的线条。
艾克斯融合完成！
“队长，出现未知的怪兽，不！巨人！”千晶望着屏幕里的艾克斯道。
神木队长则是望着艾克斯发呆。。
“艾克斯我们上！”凌天手持艾克斯终端道。
“好，上吧！”
艾克斯飞快的冲向迪玛珈，一脚踢退了迪玛珈，然后一拳打向迪玛珈的头，然后又一拳打在迪玛珈的腹部，再抓住迪玛珈的头，一膝盖顶在迪玛珈脖子上，再一个回旋踢把迪玛珈踢倒。
艾克斯又准备冲上去，不料迪玛珈一顶把艾克斯击退。但艾克斯又冲了上去抱住迪玛珈的头，然后一肘顶在迪玛珈头上。
橘副队长也看呆了，神木队长严肃的说：“在和怪兽战斗啊。。”
迪玛珈一个甩尾把艾克斯打倒，然后冲上去咬住艾克斯的胳膊并一甩把艾克斯甩飞，又走过去再去咬艾克斯，艾克斯抓住迪玛珈的头不料迪玛珈一顶把艾克斯顶倒在地，迪玛珈又走向艾克斯，艾克斯一脚把他踢开，然后冲向迪玛珈。迪玛珈一发高热射线把艾克斯打飞，然后对准了明日奈和大地发射了一枚熔岩弹！
“不好，大地、明日奈！”凌天控制艾克斯扑了过去帮大地和明日奈挡住了熔岩弹，但艾克斯也精疲力尽的倒在地上，胸前的X形计时器也变成了红色。
神木队长呆呆的望着艾克斯道：“他用生命帮明日奈和大地挡住了攻击。。”
“队长，我们来了！”阿渡和隼人驾驶着碧空马斯凯迪道。
神木队长对两人说：“去支援那个巨人！”
两人先是犹豫了一下。
“去支援！”神木队长对两人大吼了一声。
于是两人驾驶着碧空马斯凯迪飞向迪玛珈，此时迪玛珈一巴掌拍在艾克斯脸上，准备再来一巴掌的时候，一连串的梵顿光子炮将迪玛珈打到一边，艾克斯一个后空翻翻了起来。
艾克斯道：“真是不错的伙伴啊！”
凌天笑了笑道：“当然，那么我们也上吧！”
艾克斯的计时器变成了金色，身上也发出来淡淡的五颜六色的光。艾克斯将右手举过头顶，同时右手也发出蓝色的线条，然后艾克斯的左脚划出一条蓝色的弧线，双手也一起向后，四周游走着淡蓝色的线条。
“扎纳迪姆光线！”
艾克斯双手立刻组成“X”形，并发出蓝色的光线打在迪玛珈身上，迪玛珈不甘的吼了一声，便炸成了碎片，然后几条淡蓝色线条组成一个光点落在了地上。
艾克斯变回了凌天，凌天捡起了迪玛珈的火花人偶并叫醒了大地和明日奈。
“迪玛珈呢？”大地模模糊糊的问道。
凌天笑了笑说：“被巨人消灭了啊！”
“巨人？”明日奈问凌天说。
神木队长道：“那个巨人到底是谁？”
凌天微笑着说：“我也不知道，他是未知的超人，或许是人类的救世主。未知，那么他叫艾克斯奥特曼！”