金藻单细胞运动型的繁殖，常以细胞纵分裂的方式形成2个子细胞；群体运动的种类，常以群体断裂成2个或2个以上的段片，每个段片发育成一个新的群体；有囊壳的种类，原生质体纵裂为2个子细胞，其中一个子细胞游出囊壳，固着于基质上，群体类型则附着于母囊壳边缘，子细胞原生质分泌出纤维素质的新壳；不能运动的种类，以游动孢子进行生殖。游动孢子有1～2条鞭毛。有的金藻可以产生不动孢子。
形成不动孢子时，细胞停止运动并变圆，在原生质里面先分泌出一层纤维素膜，此膜渐变厚，有二氧化硅堆积而变硬，顶端有一开孔，膜外原生质经孔口移入膜内，孔口由一胶质塞子或二氧化硅化的塞子封闭起来，原生质内积累大量的金藻昆布糖和油。不动孢子可度过不良环境。有性生殖是同配，仅在少数属中发现。
4.金藻的代表植物
（1）黄群藻属（合尾藻属）。属于金胞藻目。植物体呈球形或椭圆形，是能运动的群体。群体细胞在中央以胶质互相黏附。细胞无壁，有原生质分泌的果胶质膜，膜上镶嵌有硅质小鳞片，小鳞片覆瓦状螺旋排列，鳞片表面有刻纹或硬刺，是种的特征。细胞内有2块载色体，前端有2条不等长鞭毛。细胞分裂时果胶质膜也会分裂。
黄群藻属约有10种。在小池塘和人工贮水池中生活，于晚秋、早春或冬季可大量出现。
（2）锥囊藻属（钟罩藻属）。属金胞藻目。植物体单细胞或联成树状群体。细胞着生于纤维素质的钟形囊壳中。细胞内有2条载色体，眼点明显，顶端有2条不等长鞭毛，群体运动不灵活。通常进行营养繁殖，有性生殖是同配。
锥囊藻属约有17个种。多数浮游生活于贫营养的淡水中，水中有机质多时就消失，有的种也生活在酸性泥炭水体中。已知有2个种属于海产。
（3）金枝藻属。属于金枝藻目。植物体为分枝的丝状体，基部有1个细胞特化成半球形固着器，附生于其他藻体上。细胞内有2块色素体，贮存食物为粒状金藻昆布糖。生殖时在细胞内产生1、2、4、8个游动孢子，游动孢子有2条不等长鞭毛。
本属约有3种。在池塘、湖泊和沼泽地等水中，附生于其他藻体上，是罕见淡水藻类。
金藻门中常见的还有单鞭金藻属（金光藻属）和鱼鳞藻属。单鞭金藻属植物体单细胞，1根鞭毛，原生质体裸露，有的种可变形。鱼鳞藻属植物体单细胞，无细胞壁，果胶质膜上有硅质小鳞片，呈覆瓦状螺旋排列，每个鳞片上有1硬刺，1根鞭毛，另有1根退化。
甲藻
1.甲藻的分类与分布
（1）认识甲藻。甲藻是藻类植物的1门。除少数裸型种类外，都有厚的主要是纤维素组成的细胞壁，被称为壳。
甲藻的光合色素为叶绿素a和叶绿素c、β-胡萝卜素，叶黄素类为硅甲藻素、甲藻黄素、新叶黄素及甲藻所特有的多甲藻素。全世界约有130属，1000多种。多数为海产种类，少数产于淡水及半咸水水体中。中国常见的淡水种类有4属 15种，罕为共生或寄生性；温暖水域中的比寒冷水体中的多；海产种类的形态变化较大。
（2）甲藻的主要种类。原甲藻属海中生的种类有啮蚀原甲藻，细胞卵形，细胞壁很薄。当原生质膨胀时，将细胞壁分成左右不等的两瓣。细胞前端略凹入，在凹入部位生出两根鞭毛。
双甲藻属细胞卵形或略似心脏形，后端尖，前端或中端略宽，左右则扁。壳自中央分成左右相等的两瓣，鞭毛两根，壳面上除纵裂线两侧外，其他部位布满孔状纹。常见的种类有闪光双甲藻，有发光现象，是形成赤潮的主要种类。
裸环藻属细胞圆形或椭圆形。角质膜上无纹或有条状纹，藻体为金褐色，绿色，也有蓝色或绿色的。它也能形成赤潮，如华美裸环藻。
夜光藻属藻体大，呈单细胞球形或肾脏形，成体横沟不明显，纵沟与口沟相通，末端生出一个触肢，两鞭毛退化，细胞中央为大液泡。藻体无色或蓝绿色，有时中央为黄色。它为主要发光浮游藻。每升海水中含量达到100万个藻体时，将形成赤潮。这种藻分布极广，在世界各地都有。
翅甲藻属细胞横沟的边翅伸向前方成漏斗形，壳面有孔状纹。如具尾翅甲藻。
管甲藻属藻体细长，横沟斜生于细胞前部，上壳短小，下壳很长。纵沟位于下壳前端较细的部分（颈部），鞭毛在纵沟末端，只有横鞭一条。常见的有具刺前管藻。
旋沟藻属这类藻都生在海洋里。常见的有条纹旋沟藻：细胞前端略尖，后部钝圆，末端有2至多个小短刺，壳面上有明显的条纹及网纹，能发光。
多甲藻属细胞球形，椭圆形或多角形，大多数为双锥形。前端常成细而短的圆顶状，或突出成角状，后端钝圆叉分成角，或有2～3个刺。细胞腹面略凹入，因此顶面观为肾脏形，多数种类壳片上都有花纹。我国沿海常见的种类有：锥多甲藻，扁多甲藻。
角藻属角藻是常见的浮游甲藻类，藻体为单细胞或几个细胞连成链状。细胞有一个很长的顶角，底角2或3个，海生角藻的两底角多弯曲向前，末端开口或封闭，也有的末端呈扁平片状或掌状分枝。还有些种类一个底角发达，另一个底角短小或完全退化。横沟在细胞中央，环状。细胞腹面中央为一斜方形的透明区，由数块薄片组成，纵沟即在此区的左方。透明区的右侧有一个锥形的沟，是用来容纳另一个个体的前角以联成群体的，细胞具有许多甲片。壳面有孔状纹。常见的有三角角藻。
（3）生态分布和意义。甲藻分布十分广泛，海水、淡水、半咸水中均有分布。多数种类生活于海洋中，几乎遍及世界各大海区，是海洋浮游生物的一个重要类群，在海洋生态系统中占有重要的地位。甲藻通过光合作用，合成大量有机物，其产量可作为海洋生产力的指标。甲藻同硅藻一样，也是海洋小型浮游动物的重要饵料之一。
淡水中甲藻的种类不及海洋中多，但有些种类可在鱼池中大量繁殖，形成优势种群，如真蓝裸甲藻是鲢鳙的优质饵料，素有“奶油面包”之称。光甲藻对低温、低光照有极强的适应能力，是北方地区鱼类越冬池中浮游植物的重要组成成分，其光合产氧对丰富水中溶氧，保证鱼类安全越冬有重要作用。
某些甲藻是形成赤潮的主要生物，对渔业危害很大。由于引起赤潮的生物种类不同，其危害程度和方式也不同，夜光藻等赤潮种类，可使海水缺氧，堵塞动物的呼吸器官，而导致生物窒息。而有些甲藻可分泌毒素，毒害其他水生生物，如短裸甲藻，分泌神经毒素，直接释放到海水中，使鱼、虾、贝类大量死亡。多边膝沟藻则在藻体死亡后产生毒素，危害海洋生物。有些种类对鱼类、贝类不造成致命影响，但毒素可在它们体内积累，如果人类或其他脊椎动物食用了这些有毒鱼类、贝类就会引发中毒、死亡。
2.甲藻的主要特征
大多数的甲藻为单细胞，少数种类为球胞型或丝状体。
通常来说，细胞为球形或者是长椭圆形。甲藻有的没有细胞壁，细胞裸露，但是有些有细胞壁，但是细胞壁的厚度也是有区别的，要么较厚，要么比较薄。藻由左、右两个对称的半片组成，没有纵沟和横沟。板片是横裂甲藻细胞壁的组成部分。一般情况下，板片的表面有圆形孔吻或者是窝纹，有时也会有角、刺或突起。当然，板片的形态构造和组合情况也是有标准的，横裂甲藻多具1横沟和1纵沟，而横沟也被称为腰带，在细胞中部偏下部位，横沟上部称上壳或上锥部，下部称下壳或下锥部，纵沟也称腹区，位于下壳腹面。甲藻有很多载色体，形状多为盘状、片状、棒状或带状。如果将其放在显微镜下进行观察，载色体由3层膜包围，外层为载色体内质网膜，与核膜并不相连，载色体膜为里面两层。
由3条类囊体叠成的束为光合片层，其含有多种元素，如叶绿素、胡萝卜素、多甲藻（黄）素、硅甲藻素、甲藻素、硅藻黄素……因为与叶绿素的含量相比，黄色色素类的含量要大很多，所以，载色体通常呈黄绿色、橙黄色或褐色。而淀粉和油是同化产物。除此之外，有些甲藻也有蛋白核。
甲藻有着非常大的细胞核，在分裂期间染色体呈现浓缩的螺旋状态；而在染色体中有非常少的组蛋白，一般情况下，DNA的复制呈现两种情况：一种在细胞生活的周期中，DNA不间断地进行复制，这与原核细胞DNA的复制非常相似；而另一种与真核细胞有相似情况，DNA的复制有间断性，其复制需要在一定时间内进行。
甲藻细胞为有丝分裂，在分裂的时候核膜核仁并不消失，核内没有纺锤丝，染色体附着在核膜上或特殊的着丝点上。核膜凹陷形成沟管，而沟管横贯于细胞核，在沟管内的细胞质中有纺锤丝。中期没有真核所具有的中期板，后期核向两侧扩展，染色体移至核相对的两端，以环沟在核中部将核分开形成两个子核，这种核被称为中核或甲藻核。
甲藻的运动细胞有两条顶生或侧生鞭毛。这两条顶生鞭毛，一条直伸向前方为尾鞭型，另一条伸出后横向弯曲，为茸鞭型。从横沟与纵沟交叉处的鞭毛孔伸出的为侧生鞭毛，其中一条在横沟中，为茸鞭型，被称为横鞭毛，另一条沿纵沟向后方伸出，为尾鞭型，被称为纵鞭毛。在鞭毛鞘内有多条轴丝。
在甲藻细胞体表层有甲藻液泡，它是一种没有伸缩能力的囊状体，细胞体通过囊状体外端的一个开口与外界相通，起着渗透营养的作用。除此之外，甲藻还有一种从高尔基体长出来的刺丝胞，当甲藻遇到袭击的时候就会放出刺丝胞，只要刺丝胞被放出后就不会再收回，直到被水所溶解。
3.甲藻的繁殖方式
甲藻的繁殖主要是通过细胞纵裂，但也不排除其他一些形式，如产生游动孢子、不动孢子和厚壁休眠孢子。
多年来，随着海水富营养化进程的加快，甲藻爆发式的增长繁殖不断出现，导致水华形成。如果水华持续不断的发生必然会导致赤潮的形成。由于甲藻密度过大，所以在其死亡之后，藻体必然会导致大量细菌的滋生，最终使水中溶解氧不断下降，甲藻毒素产生，严重威胁着渔业的发展，造成重大的经济损失。与此同时，富集甲藻细胞的动物所释放的毒素，也严重威胁着人体健康。当甲藻死亡后就会沉入海底，成为古生代油地层中的主要化石，所以，在勘探石油的时候，工人们通常通过甲藻化石来判断是否有石油存在。