前已述及，1945年抗战胜利后，蒋介石称赞马步芳是“抗战有功将领”，意在拉拢，使其成为一支“反共”的力量。同年12月，蒋介石60寿辰，马步芳派马继援赴南京参加庆典，并与白崇禧联系。1946年12月，蒋介石召开国民代表大会，制定宪法，宣布实行所谓宪政。当时国民党内部争权斗争激烈，桂系李宗仁、白崇禧欲取蒋而代之。据说马步芳曾密令青海代表站在李、白方面，从而开罪于蒋。于是会议期间，在军统特务操纵下，以“新青海建设团”分子为骨干，散发反马步芳的传单，使会议为之骚然，轰动于一时。马步芳闻讯，慌忙指使青海参议会和各盟旗王公、藏族千百户代表分别致电南京蒙藏委员会，为自己歌功颂德，指斥反马分子系“反动分子盗窃民意，捏造事实，妄加诬蔑”，要求“查明造谣之人，依法惩办”。蒋介石转而好言安抚，复电云“为政之难，古今同然”。吴铁城则来电称“总裁……对兄倚畀正殷，尚希任劳任怨，以固边圉”。后果然于1947年升任马步芳为西北行辕副主任兼青海省政府主席，并调马步芳部队开赴陇东，配合胡宗南和宁夏、甘肃部队，在内战前线，充当急先锋。马步芳乘机伸手向蒋介石要了一笔开拔费，又在青海发动大规模的“捐献”运动，榨取人民财物之后，从3月26日开始，部队陆续开拔，还在西宁驱使城市居民和农民列队欢送。4月8日，以整编第八十二师为主力的“青马”部队，由师长马继援率领，到达平凉，将其部队分别驻扎于平凉、宁县、正宁、西峰镇、泾川一带。之后，又以西峰镇为重点，将部队驻地作如下调整：（1）八十二师直属队和骑八旅二团，驻西峰镇、肖金镇、驿马关；（2）骑八旅直属队进驻庆阳；（3）骑八旅重兵器营及甘肃保安二团驻合水县；（4）骑八旅第一团驻庆阳东南的赤城；（5）独立骑五团驻正宁县；（6）八十二师特务营、骑八旅一个连及兵站驻平凉；（7）一百旅直属队及第一团驻宁县，第二团驻早胜镇，第三团驻镇原县；（8）青海省保安骑兵一、二团分别驻泾川县城和平凉。当时西北行辕在平凉设前进指挥所，由杨德亮负责。开始，马继援与杨德亮之间尚能表面应付，后来，马继援对杨的指挥产生嫉妒。此时师参谋长马绍武从上海获悉：胡宗南可能令杨德亮担任整编八十二师师长。这一信息，遂使马步芳父子起而积极倒杨，终至迫使西北行辕于是年8月份宣布将此前进指挥所撤销。马步芳父子除却眼中钉，野心更大了，在陇东地区收买人心，拉拢各界人士，妄想达到统治西北的目的。
1．合水之战
1947年5月27日下午，人民解放军包围合水县城，以猛烈炮火进攻。“青马”骑八旅重兵器营马生智、甘肃保二团李鸿轩慌忙拒守，并向马继援乞援。马继援急令驻庆阳的骑八旅旅长马步銮率旅直属队和一团星夜驰援。马步銮对路经地形未作侦察研究，盲目向合水直扑，被解放军诱入一个山沟的“口袋”中，遭受沉重打击，死官兵300多人、马400多匹，旅直属一个连全部覆没，狼狈败回庆阳。解放军对合水攻势甚猛，马生智营不支，解放军冲入城内，巷战两小时，“青马”部退守城内西山坡城角。马继援要求西安绥靖公署派出一架飞机前来助战，该机盲目投弹数枚而去，无济于事。马继援继派八十二师副师长马全义率骑兵从北路驰援，29日下午到达距合水城约10公里的太白乌塬，被解放军阻击，马全义腿部中弹，双方相持至次日清晨3时，“青马”驻宁县的一百旅谭成祥部已到距合水5公里的板桥，太白乌塬和合水的解放军主动撤出战斗。是役，“青马”部在太白乌塬被击毙击伤160余人、战马20余匹；在合水死连排长六七人，士兵320多人，战马210余匹。但事后马步芳宣称合水大捷，向蒋介石邀功。国民党一些御用报纸为之大肆吹嘘，《中央日报》以“扬威陇东的马继援”为题，捏造所谓“合水之胜”。蒋即发给勋章、奖品，拨款230万元犒赏。马步芳特派其民政厅长郭学礼率歌舞团到合水、庆阳、西峰等地慰劳，又增派一百旅第二团韩得功部进驻合水，并委师部高参马仲福（马仲英胞弟）为合水县长，加强合水的统治和防务。
2．进犯子午岭
这时马继援甚为狂妄，日夜伺机消灭解放军。1947年8月13日，马得悉解放军约一个纵队兵力有向正宁推进模样，即于15日调动骑八旅、一百旅、独立骑五团以及师直4个独立营共约8个团的兵力，亲自率领，扑向子午岭；又令骑八旅马步銮部快速迂回，企图一举包围解放军。时值深秋，阴雨连绵，道路泥泞，部队行进，苦不堪言。17日，其部在九岘塬与解放军接触，从早10时至下午3时双方激战3个小时，解放军火力逐渐稀疏，“青马”部狐疑，不敢前进。约1小时后，组织骑兵作试探性冲击，始知解放军已撤向子午岭。此次“青马”部死200余人，马50余匹。而马步銮为大雨所阻，未能如期赶到，原拟计划落空，马继援甚为懊丧。战斗结束后，马步銮部始慌忙赶来，马继援又下令追击。骑兵横冲直撞，午夜进至山深林密处，恐遭伏击，遂就地休息；第二天10时左右到达子午岭，却只遥见少数解放军向东移动，不敢贸然追击。马继援命令架起报话机，向西宁马步芳报告战况。马步芳指示他说：“你赶快掉头返回西峰镇，不要怠慢。你们已经深入到‘加牙’（暗语，指解放军）的手掌了。这个‘加牙’的地方，过去隔壁（指西安）的尕人（指胡宗南）从来不敢去的，你们太冒险了。”马继援遂立即率部返回。
3．西府战役
1948年，在西北战场的人民解放军已转入进攻形势，4月22日，收复延安。彭德怀司令员又率解放大军渡泾河南下，长驱直入，相继解放邠县、长武、麟游、扶风、武功、凤翔和宝鸡等10余县市，西安、兰州震动。胡、马两军慌忙应战。4月23日，马继援奉西北行辕命令，日夜兼程向长武、邠县前进，以配合从西安出动的胡宗南第五兵团裴昌会部，沿西兰公路东西夹击在宝鸡一带的人民解放军。马继援除留独立骑五团、工兵营、甘肃保二团留守后方外，亲率所部主力，沿肖金镇、和盛镇、长庆桥公路线，向长武推进。马继援原拟抢先占领长武，不料25日中午，当马全义、马步銮所率骑兵刚刚到达距长武以西10余公里的窑店时，已遭到解放军的阻击，马继援下令攻击，激战7小时左右，解放军撤离长武。“青马”部追击，26日中午在长武以东的冉店桥又和解放军接触，解放军据桥固守，“青马”部几次猛攻受挫，直至下午4时左右，解放军才放弃冉店桥阵地，向南转移。27日晨，马得胜、马英两个骑兵团到达邠县以南崔木塬地区，时解放军约一个纵队已在该塬南端构筑简单工事，阻其前进。马继援到后即下令攻击，并向西安绥署告急，要来飞机3架助战。马得胜、马英骑兵多次猛攻，都被解放军火力所阻，死伤甚多。双方展开白刃战，3架飞机狂轰滥炸，“青马”部官兵亦被飞机炸死炸伤不少。黄昏时候，“青马”增援部队骑八旅赶到，解放军迅速撤出战斗，南向转入麟游。马得胜、马英率残部追击一段，恐中伏击，调头转回，途中无意截获解放军一支辎重部队和负伤人员。是役先后俘获解放军战士1200余名，但“青马”部亦死伤连长以下360余人、战马320余匹，马继援率部返回长武。他虽然得了一些小便宜，但看到解放军灵活机动的战略战术，不禁胆怯心慌，在对团长以上军官讲话时说：“共军这次深入关中，横跨泾渭河谷地带，直驰宝鸡，必有大计。当然在宝鸡不会久留，不长时间内，一定会调过头来找我们进行报复，我们必须注意。”他命令严防“敌人奸细”，并将所有家眷一律送回青海，不准留住，还将其原来分散驻防的兵力，加以收缩，集中于西峰地区和平凉地区。在此期间，解放军西北副司令员赵寿山曾给马继援来过一封劝告信，劝告他“能够退防，率部回青，或归向人民解放军，决不要上蒋介石和美国人的当，不要做他们的牺牲品”。但马继援非但未受感召，反而将原信送给西北行辕，向蒋介石表白邀功，还向访问记者发表狂言：“赵寿山让我派员找他联系，我的确派人去了，所派的人是骑八旅和青保骑一团。但遗憾的是没有找见他，今后我还要派更多的人去找他。”
1948年5月上旬，蒋介石命令胡宗南与马继援协同，在陇东地区歼灭解放军西北部队。胡即调动第五兵团裴昌会部，在沿西兰公路的邠县、永寿、长武一带集结，其整编六十五师李振进抵泾川和荔镇地区，与马继援联防。马继援派师部作战科长学罗炘驻长武，与胡之第五兵团联络，并决心积极策应第五兵团，协力围歼解放军。但马继援摸不清解放军的动向，焦灼不安。适西北行辕电令八十二师主力迅速向镇原县屯子镇地区移动。马遂立即率部向屯子镇进发。屯子镇是屯子塬上的大镇，有几百户人家，筑有土城，城南有一道七八丈深的大沟，形成一道防御屏障，东、西、北三面则是一片开阔的平原。时解放军已在城内据守。青马驻镇原县的马登霄团于5日上午11时到达，先在镇西与解放军发生战斗，继而部署各营攻城，战二三小时，未能得手。副师长马全义率一百旅和独立骑五团赶到，即部署兵力，在镇东北两面进行包围攻击。斯时“青马”兵力远远超过解放军兵力，马全义颇有信心，马继援来电云：“只要我们严密谨慎包围，奋力作战，一夜即可大功告成。”可惜他高兴得太早，下午6时左右，解放军约六七千人，从该镇西南方向神速迂回过来，将“青马”部紧紧包围，使之遭受背腹夹击。“青马”部反复冲锋突围，白刃相交，杀声震野，均未得逞。他们盼望骑八旅马步銮从平凉来援救，却不知马步銮早被解放军阻止在屯子镇西南的涧沟以南，不能前进；马步銮想迂回赴援，又因天黑路险，不知解放军何处有埋伏，不敢贸然行动，被迫在牛蹄坟地区停滞整整一夜。由于外围解放军的猛攻，迫使“青马”部将主要力量应付外线，对屯子镇围困的力量大大减弱，镇内解放军乘机在镇西南城角开辟一条退路，沿沟涧退出撤走。随之，外围解放军由于解围任务已完成，一阵猛攻之后，也分路撤向宁县方向。结果，马全义一无所获。
在屯子镇激战的同时，马继援率师直属部队4000多人在马头坡和解放军六七千人遭遇。马继援被压在马头坡的半山腰，地形不利，只好强力仰攻，从上午9时到下午5时，激战8小时，第一线兵力死伤惨重，连长李成让毙命，营、连长三人负伤，特务团长杨修戎竟在马继援面前放声大哭。最后驱师司令部各级官佐和勤务、伙夫一起上阵，拼命挣扎。马继援面如土色，满头大汗，在报话机上拼命叫嚷，调动援兵。后来，谭成祥率第一百旅从屯子镇赶来，解放军才撤出战斗。晚8时左右，马继援到达马头坡塬，向西宁马步芳汇报战况，马步芳紧张心情才得解除，又令马继援向宁县方向追进。此次屯子镇、马头坡等战斗中，“青马”部死伤官兵700余人、马200余匹。
马步銮由于没有完成马继援令其救援屯子镇的任务，恐惧不安，即转向荔镇急进，妄图捡点便宜，将功折罪。中途抓到5个老百姓，马步銮向他们盘问解放军的行踪。5个老百姓说：“解放军多得很，正在西塬上走着。”马步銮立即命令部队停止东进，转而向西追击，在玉都庙塬和一支部队遭遇，双方展开激战。马步銮感到对方大炮甚多，火力甚猛。即向马继援告急求援。斯时马继援正被困于马头坡，自顾不暇，哪有援兵！原来对方不是解放军，而是国民党六十五师李振部队，他们是向屯子镇方向推进，策应“青马”的。当李振看到对方全系骑兵，且持有大刀，心即生疑，对被俘的几名马部士兵进行审问，由于广东话与青海话不通，几个俘虏兵的“友军”两个字，无法使李部人员听懂，最后用笔写出，才使李振恍然大悟，立即停火。在这次约四五小时的误会战斗中，据骑八旅副旅长李文彬和六十五师参谋长孟全义讲，双方死伤不下300余人，马步銮部死伤150余人、战马90余匹。马继援大骂马步銮，让他自己向马步芳汇报此事。马步銮在报话机上向马步芳汇报时，开头马步芳很不满意，质问马步銮：“我们伤亡的多，还是西安‘尕人’（指胡宗南）伤亡的多？”马步銮见机行事，立即回答：“我们伤亡的很少，‘尕人’伤亡比我们大几倍。”马步芳转怒为喜地说：“好！你打的对，我们在装备劣势、寡不敌众的情况下，没有吃大亏，这就是我们的胜利。若不对西安‘尕人’来这个硬头，他们不知道我们的厉害。”胡、马之间的钩心斗角于此可见一斑。
和马步芳一样，马继援也残忍地屠杀战俘。“青马”部将解放军被俘人员700多人，集中在宁县城内5个坑院中，坑院顶和门口岗哨林立，戒备森严。5月7日，解放军从屯子镇、马头坡撤向正宁县方向，是日上午将宁县城包围，进行攻击。城东、北、西三面的据点均被解放军攻破，城内一片混乱。八十二师部高参张彦和工兵营长谭腾蛟也慌了手脚。被押的解放军战士在“中国共产党万岁、毛主席万岁”的口号声中，以土沙向“青马”部哨兵面部猛打，想夺取武器冲杀出去。谭腾蛟率部堵住院口，用冲锋枪扫射，前面的解放军战士立即牺牲。谭又下令将5个坑院的俘虏全部杀害，顿时枪声、手榴弹声和怒吼声响成一片，700余名赤手空拳的解放军壮烈牺牲。谭腾蛟这个刽子手欠下了人民一笔擢发难数的血债！
8日晨3时左右，马继援率部赶到宁县，但解放军已先期撤走，经正宁转入陕甘宁边区根据地境内。西府战役即告结束。
马继援对谭腾蛟残杀俘虏也心有余悸，但他到底比较“高明”，指示谭赶快埋掉尸体，洗净血迹，“也不能让老百姓去看”。谭遵命办理，将尸体一面掩埋，一面填进水井，填满水井六七个。次日，西北行辕来电说：“宁县俘虏营中有新四旅司令员程悦长，速即查明上报。”马继援即令政工处副处长王洛宾赶到宁县，将几名俘虏尸体挖出，拍成照片送往西北行辕了事。
注：①陇东黄土塬，是在平地上挖很深的大坑，在坑内四周挖成窑洞居住。