群雄纷起争汗位。
残元的灭亡，使明朝失去了政治上的敌人，蒙古已经成为了“边患”，而不再是前一王朝残余势力。因此，永乐皇帝对于贵力赤表示了极大的友好，承认了他对于蒙古各部的宗主权。但是，贵力赤也并没有保持汗位有多久，便在1400年被阿苏特部首领阿鲁台和卫拉特部首领马哈木的联军打败。阿苏特部是蒙古化了的伊朗人，起源于高加索，因蒙古西征而进入中国，元朝军队中有一支由他们组成的军团。而卫拉特部是森林蒙古人中的一个强大的部落，在成吉思汗时代被称为“林木中百姓”，定居在贝加尔湖西岸。
阿鲁台和马哈木都不想成为蒙古帝国的大汗，他们最为希望的还是自己的部族独立于蒙古人之外而获得承认，因此，在打败贵力赤后，便向明朝效忠，表示自己不同于其他争夺蒙古帝国汗位的部族。这样的臣服是明朝求之不得的，给了他们极大的支持。依靠这种支持，卫拉特部将其霸权扩张到从贝加尔湖西岸到额尔齐斯河上游的整个西蒙古地区。
然而，阿苏特部和卫拉特部对于蒙古中部和东部控制都没能长久，贵力赤之子额色库重新崛起，要与阿鲁台和马哈木争夺大汗宝座，双方进行了十几年的战争，直到额色库于1425年病死。
在额色库不停的与阿鲁台和马哈木争夺最高宗主权的同时，在1403年，残元末代皇帝额勒伯克之子本雅失里复辟了自己的汗位，宣布自己为蒙古帝国的大汗。作为黄金家族的后代，本雅失里无疑要比阿苏特部和卫拉特部具有号召力，不久，包括阿鲁台在内的各蒙古部落聚集在这位正统代表者一边。而好不容易盼到忽必烈家族衰亡的明朝，对这位新一任蒙古大汗的敌视是不言而喻的，永乐皇帝下旨要本雅失里作出臣属的明确表态。但希图重现祖上功业的本雅失里怎么会向推翻自己家族在中国皇位的朱氏家族表示臣服呢？于是，永乐皇帝亲自率军进入蒙古，直抵成吉思汗故地--鄂嫩河上游平原，于1410--1411年击溃了本雅失里和阿鲁台的军队。这次失败对本雅失里来说是致命的，因为这使他丧失了作为大汗的权威。1412年，卫拉特部首领马哈木乘机将他击败，夺取了汗位。
在此之前，马哈木一直与明朝永乐皇帝保持着友好关系，但这时，他已经真正成为蒙古帝国的大汗了。于是毫不犹豫地与明朝皇帝断交。这引得永乐皇帝再次亲征蒙古，虽然马哈木的抵抗使明朝军队遭到严重损失，但为了保存实力，他率军撤退到土拉河以西休养生息。马哈木的威信由于这次入侵暂时受损，因为他也未能阻止明朝军队进入蒙古草原。
哈斯木逃走后，大汗宝座又悬空了下来，这时，居住在兴安岭以东、满洲边境的嫩江附近的科尔沁部首领阿台在1425年率部众占领了蒙古中东部地区。那个见风使舵的阿苏特部首领阿鲁台，这回又支持阿台杀死了本雅失里，拥立阿台为蒙古帝国大汗。科尔沁人是成吉思汗弟弟哈撒儿的后裔，也属于黄金家族。虽然永乐皇帝对于卫拉特的背叛不能容忍，但为了消灭在蒙古人中具有崇高威望的黄金家族，又开始支持卫拉特部。自然，对于这支持，卫拉特部也是欣然接受的。
定鼎卫拉特。
永乐皇帝所贯彻的为了打倒黄金家族而扶持卫拉特势力的政策，在他死后才发生了效力。在1434至1438年间，卫拉特首领、马哈木之子脱欢率军攻进蒙古东部，杀死了帝国大汗阿台和他的重要辅臣阿鲁台，夺得了大汗宝座。虽然，黄金家族--忽必烈家族的一个王子、额勒伯克之子、本雅失里的兄弟阿占在此时被拥护正统的首领们宣布为大汗，但在事实上，蒙古的帝国已经从黄金家族--忽必烈家族转到了卫拉特--绰罗斯家族人手中。
对于明朝皇帝来说，成吉思汗的黄金家族已经完结了，草原的这些新君主是一支没有显赫历史的民族，他们在蒙古帝国的历史上既不显赫也不重要，他们不可能如黄金家族那样具有无上的威望和号召力。那么，蒙古人对于中原的威胁就应该自此结束了。
但是，卫拉特人并没有忘记他们继承的是蒙古帝国的汗位，虽然在表面上，他们把自己和其他蒙古人尤其是黄金家族的距离拉得很远，但他们无时无刻不在想着恢复蒙古帝国原来的疆域。
当然，在明帝国还很强大的时候，卫拉特人是不会随便捋虎须的，他们还记得祖上马哈木的教训。因此，恢复帝国的第一刀他们向东南地区的察合台汗国砍去。脱欢的儿子额森击败了察合台汗国的卫思汗，强娶了他的妹妹哈尼木公主，因为卫思汗是黄金家族，所以这一联姻，使得卫拉特人有了足以号召所有蒙古人的血统。
额森继承其父脱欢的汗位时，蒙古帝国的疆域从巴尔喀什湖延伸到贝加尔湖，又从贝加尔湖延伸到长城附近地区，象征正统的都城哈拉和林也是帝国的领土之一。1449年，他向中国公主求婚遭到悔婚，于是，额森蹂躏了山西北部、大同附近的中国边境。明朝英宗皇帝及太监王振前往迎战。在土木堡展开战斗。额森给明军灾难性的打击，歼灭明军10余万，俘英宗皇帝。然而，因不善围攻战，额森无法攻陷该地的设防城市大同和宣化，于是，带着俘虏英宗皇帝帝返回蒙古。
三个月以后，他卷土重来，进军至北京西北郊，但是，他遇到明朝名将于谦的抵抗，发动的各次进攻都被打退，不久明朝的各路援军赶来。由于受到优势兵力的威胁，他沿居庸关撤退。1450年，额森决定释放英宗帝，并于1453年与中国议和，并宣布自己是中国的属臣，这一行动表明他抛弃了蒙古帝国的宗主权，把自己看成是一个独立的可汗。这样做无疑并不明智，原本已经臣服于他的各黄金家族的部落和汗国又重新自立。
1455年，额森被暗杀。额森之子阿马桑赤台吉继其父汗位，在1456入侵察合台汗国，在伊犁河附近打败了在位的羽奴思汗。而在这时，皇后哈尼木在后方制造混乱，她的儿子亦不刺忻和也里牙思两兄弟对阿马桑赤发动叛乱，却没有成功。但经过这次内乱，卫拉特的实力严重的被削弱了。
黑夜里，那身影正一点一点慢慢的朝我靠近，我暗自骂了声：“好，来一个杀一个，来两个杀一双！”就在这时，那黑影忽然身子一阵腾空，以快如迅雷般的速度窜了过来，我一惊，手中龙吟剑来不及多想，一招‘凤舞九天’朝那黑影的胸口刺去，那好黑影的身法极为灵活见我招式凌厉，双腿在空中一弯，接着身子在空中快速的转了几圈，身法快速之极。我心中一惊，暗道：“想不到鞑子军营之中竟然有这般高手！竟然如此那好，也往你见识唐大爷的剑法，好让你看看我大明武学！”当下也不顾那身影身法是如何的迅速，一招‘风云变幻’直取那身影的周身要害。这《广寒剑法》乃当年武林第一人澎莹玉和尚据塞北极寒之地的风云变幻的气象所创，而这招‘风云变幻’尤为厉害。那身影见我这一招‘风云变幻’盘旋飞舞，曲直相乘，好象波浪的四面扩张，当真是变化莫测，令人防不胜防。心下大惊，急忙变幻身影，我恼那身影是鞑子，这一招施了杀手，身形平地拔起，剑势凌空击下。
在这盘旋曲折的剑势之中，我暗藏有数种不同的变化。那身影在空中不停的翻越，这时见我剑势也有如凌空扑击一样，而且每一招所藏的变化也不相同，或是一招三式，是一招五式，最多甚至有一招九式的。每一招的姿势当然也是大不相同。端是非常的厉害，心下大惊。我在黑暗之中，瞧见那鞑子身影闪了闪，显得有些凌乱，心中大乐。暗自道：“今日就让你见识见识你唐爷爷剑法的厉害！”
当下龙吟剑再次一翻，剑心抖动，一个夺剑式，就劈那黑影的脚腕，那黑影人大吃一惊，忽道：“唐大哥，手下留情，是尹俊小弟！”我一听，心中大惊，急忙撤剑，倘若我撤剑慢了片刻，只怕尹俊已是断足之灾。尹俊身影稍落，便重重的嘘出了一口气道：“唐大哥，你的剑法也太厉害了吧？我要是再迟点喊，恐怕我这条腿也就废了吧？”不觉又抹了抹额上的冷汗。我也是吓得一身冷汗，心知要是尹俊再喊慢了片刻，两条腿就算不废也会被我手中的龙吟剑所砍断。这时见尹俊一脸笑嘻嘻的神情，不由得怒火打起，怒道：“怎么回事，你怎么又回来了！”尹俊见我一脸怒色道：“唐大哥别急，嘉峪关内防疫的法子已经安全送到了！”我一愣道：“送到了，你？”尹俊我见我一脸茫然，嘻嘻笑了两声道：“唐大哥，你还记得我出来是带的那只信鸽吗？”我一愣随即明白，喜道：“这么说，防疫的方法你通过信鸽传回嘉峪关了？”尹俊面带喜色的点了点头道：“不错，此刻只怕已经到了嘉峪关吧！”我轻轻拍了尹俊的肩膀道：“好小子，真有你的啊！”尹俊一脸得意道：“那当然了，也不瞧瞧我是谁啊？”呵呵呵……呵呵呵？
深夜，那可汗望了一眼大帐外的天空，忽然转身朝那王座上走去，片刻便躺在了王座上，安然入睡。“唐大哥，现在我们怎么办？”尹俊望了一眼那可汗肥胖的身影道。我低头了思索了片刻道：“这鞑子竟然用这瘟疫来屠城，那么定有解药，这解药如此重要，那鞑子一定会放在药房之中，且派人把守，所以我们眼下只要找到药房，偷上一副药拿回去一试，便可知晓这药方！”“对，说得对！只要我们搞到了药房，还能怕这些鞑子了！”尹俊有些兴奋道。