他在工作事业上一直在奔波，在挑战，一个个的尝试，寻找他内心最最想做的事情。在加入IDG后第二年的2月，他成立天使投资基金，希望帮助更多的创新企业获得发展的机会。同年3月，他投资了奇虎公司，出任奇虎董事长，从而成为中国克制流氓网络软件和插件的主要人物之一。
怪招“不怪”
奇虎360作为互联网安全网站，肯定要扣紧安全，因为现在安全的问题，周鸿祎认为包括奇虎在内，包括其他的安全厂商，都没有说真正地把问题解决了，但用了360之后，肯定是帮助很多网民解决了一些问题。但是现在，虽然360消灭了恶意软件，消灭了流氓软件，但是还没有真正的消灭木马，木马还在不断地做技术的改进，所以他认为未来的挑战，会是一段长期的时间，这个斗争会长期进行，现在绝对要继续在安全这个领域里生根，要更加精细地运作。
“说句良心话，如果你没有安全的保障，你上网就和裸奔是一样的，你可能会中招，你的基金会被劫持，你的机器就会变成肉机，你的密码会丢失，会让你的机器变得速度很慢，甚至死机。也就是说，这已经变成每个人都不能回避的问题，互联网对每个人要用到的服务，就跟搜索，就跟聊天，就跟腾讯做的邮箱一样，在互联网里做一个基础服务，但从互联网的历史来看，它一定是免费的。”周鸿祎对互联网存在的问题分析得十分透彻，而且对解决互联网安全问题的重要性有深刻的认识。
网上有很多应用软件都是免费的，有些人从免费软件上获得了好处，但是因为使用互联网不善，而使电脑出现问题，就认为免费没好货。但是周鸿祎却不这样看，“免费做不成是谬论，实际上因为互联网络，真的是免费没好货，免费做不长？那我就问大家，互联网是怎么做起来的呢？问题是互联网它提供了恰恰一种可能性，就是因为很多在互联网这种虚拟服务啊，他的边际成本为零，也就是说，我如果给每个人都免费发衬衣，这我可能发不起，因为再便宜再便宜，你的衬衣拿烂布做，也得10块钱一件的成本，但是一旦我研发出一种产品，在网上一千个人用，和一千万人用，甚至有十亿人在用，这个成本可能是，我们固定成本是差不多的。所以我摊到这么一个用户之后，成本几乎为零。”他的关于互联网的理论很独特，对互联网的免费模式给予了有力的支持。