在海南，“万通”的全称叫“海南农业高技术投资联合开发总公司”，做的是“农业开发”的买卖。其实，1992年时的海南，所谓“农业开发”就是地产开发的代名词。他承认这第一单生意是他亲自设计操作的，他说：“我现在不拼刺刀，那是因为我拼过刺刀。”这意味着他并不以地产开发为名，是因为他做的就是地产开发的买卖。他在那里的农地里淘得了第一桶金，让人艳羡的第一大桶金。
当时，海南的房地产市场极热，有很大的泡沫存在，海南——这一美丽的地方终不是发展的长久之地。1993年万通走出海南，寻找更广阔的空间。冯仑带领万通先后在北京组建万通地产；参与创建中国民生银行并出任该行的创业董事；策划并领导对陕西省证券公司、武汉国际信托投资公司、东北一间上市公司等企业的收购及重组。
完成原始积累的万通，进入快速扩张阶段后，一方面极度繁荣，一方面分崩离析。1994年时，万通在美国投资了亚信（1995年退出，总收益达80%），是万通与网络的第一次亲密接触；到1995年，公司的触角已伸进房地产、通信、服装、商业、信息咨询、银行、保险、证券等多个领域，地盘广及北京、海南、西安、沈阳、武汉；在万通总资产达到70亿元时，北京万通的法人代表潘石屹黯然离开万通；之后，万通进入多事之秋，开始收缩——易小迪留在了广西万通；王功权远赴美国从事风险投资；潘石屹还要等三年才有东山再起的机会；冯仑则开始了他称之为“四化”的革命。总之，万通的发展受到了很大的影响。
1997年，在冯仑的努力下，万通完成了“资本的革命”，成为股份制公司。其他从万通走出去的人也分别获得了很大的成就。在万通沉默改革期间，潘石屹在现代城一炮打红；易小迪把阳光100做成了楼市新星……加上其他万通人开发的项目，在北京房地产市场上，“万通系”声名鹊起，万通本身被笼罩在“万通系”光环的阴影下，市场上开始流行起万通不行了的说法。但是，冯仑却说：“万通系”引人注目，与万通的历史、企业文化大有关系。不同于万科培养了一批职业经理人，万通培养了一批老板，冯仑自豪地说：“万通人有做老板的遗传基因。”