各种有机废渣如生物渣及工业的有机物下脚料，包括原粮、果蔬、甘蔗、油料作物以及诸多有机化工制品加工后留下的废渣中，还有许多可用的甚至是宝贵的物质，将它们提出后，可以大大提高其附加值。这类有机渣的深加工已引起科学界的普遍重视。
一、麸皮的深加工
麸皮是小麦或燕麦加工成优质面粉后留下的废弃物，通常用作精饲料。近年来，已知麸皮汁可以防止人体内胆固醇升高，这是因为其中可溶性纤维含量较高，其有效成分是β-葡聚糖。这种物质像淀粉，可以被消化，摄入后能使血葡萄糖及胰岛素和胆固醇降低。将燕麦β-葡聚糖浓缩可制得燕麦胶。在喂饲雏鸡时，饲料中搀入24％的这种胶，10天后可使鸡的胆固醇降低18％。这种胶还可作为冰淇淋、软饮料、啤酒、沙拉及调味品的添加剂，可收到明显降低胆固醇的功效。这种麸皮纤维还具有多种保健作用：如吸附胆汁酸，抑制脂肪合成；因含大量纤维素，能增加肠蠕动，因而可防止大肠癌、便秘、糖尿病、胆结石等。食用麸皮纤维的提取方法是：将100份麸皮纤维用蒸汽薰蒸15分钟，再于150℃热风中干燥15分钟，粉碎成末；搅拌下加入到由15份柠檬酸、3份蔗糖和40份去离子水配成的溶液中，使粉末料均匀吸收溶液；于烘箱中，在110℃下搅拌干燥30分钟，得成品。
二、米糠的深加工
米糠是稻谷脱壳后依附在糙米上的表层残留物，约占稻谷粒重的7％～75％。米糠中可供利用的主要成分有粗蛋白18％、粗脂肪22％、粗纤维9％、灰分10％等。我国是世界第一产米大国，年产稻谷约2亿吨、副产品米糠1500万吨，其开发和深加工有广阔前景。而且米糠是可再生资源，原料来源不枯，只要产品质量稳定，打入市场后就容易占领市场。过去只把它作为家禽或牲畜的饲料，近年来米糠油已形成规模生产。米糠含油率与大豆相仿，但米糠油营养丰富，为食油中上品，不仅脂肪酸品种较全，而且含有较多的维生素E及谷维素，有降低血压的作用，是高血压患者的理想食用油。将米糠油深加工，可得到精细化工产品用于制作高级表面活性剂、黏合剂、塑料助剂、合成润滑剂及纤维柔软剂等。脱脂后的米糠粕的植酸钙含量达10％以上。植酸及其盐在医药上最重要的应用是制造肌醇，可用于处理脂肪与胆固醇新陈代谢失调，治疗肝硬化。
除米糠油的生产外，我国已研制出30余个产品，但整个米糠综合利用尚处在初级阶段。从米糠利用的程序上看，制油是第一道工序，而且效益最大。制油主要有压榨法和浸出法两种。压榨法是通过加压米糠制油，是目前国内的主要方法。它具有适应性强、工艺简单、设备和技术要求低、维修方便、经济安全等特点，但生产效率低，出油率只有8％～10％，干饼残油率高达7％～8％。浸出法是利用有机溶剂如己烷等将米糠中的油脂浸出，其出油率高达12％～15％，残油率只有15％～2％。该法劳动强度低，生产效率高，溶剂可循环利用，工艺先进，代表未来制米糠油的方向。从米糠的综合利用看，制油潜力还很大，主要途径可能有：增加糠油和食用油新品种，例如糠油与红花籽油按7∶3比例调合而成的健康油，糠油与棕榈油按1∶1比例配制而成的方便面煎炸油等；直接利用米糠发展各种营养食品，如日本新开发的米糠煎饼、美国的米糠松饼等，有良好保健功能；提取米糠的化工产品，特别是油脂化工制品如应用广泛的二聚酸，美国年产量在2万吨以上，我国产量甚微，天然维生素E的产量我国不足20吨，而日本在1995年即达30万吨；米胚芽是大米的精华，在碾米中随米糠脱落混入，开发其食品强化剂国外已很普遍，而我国尚属空白。
三、甘蔗渣的深加工
甘蔗渣（包括残叶）是许多蔗糖生产国如古巴、巴西重要的农田废物之一。废渣约占甘蔗收获量的10％～20％，数量巨大。例如在印度，年产甘蔗22亿吨，可得蔗渣2200万～4400万吨。以往大多就地烧掉，温度可达600℃～800℃，使土壤中的微生物和蚯蚓等被杀死，从而导致土壤板结。其实，蔗渣是优良的造纸原料和富糖饲料，将其加工可制成优质纸和牲畜的催长添加剂，通常用于提取木糖。木糖为白色的针状晶形粉末，易溶于水，味甜爽口，甜度为蔗糖的60％，不易被人体吸收，适于做忌糖者（如糖尿病患者）的甜味添加剂。
提取木糖的过程如下：将蔗渣晒干至含水量为12％左右，粉碎至米糠状，用15倍量的1％的氢氧化钠溶液浸泡1天，间或搅拌，过滤。滤渣用等量清水搅拌洗涤4次，过滤，抽干。将风干的滤渣加4倍量6％的硫酸，煮沸搅拌4小时，冷至室温，过滤。滤渣用清水搅拌洗涤4次，合并滤液和洗液，然后在剧烈搅拌下徐徐加入相当于硫酸量90％的饱和石灰水；残酸再用碳酸钙中和，静置24小时（控制pH值为7），过滤，得中性糖液，用磷酸调至pH值为60。水浴加热，搅拌下加入总量5％的活性炭，升温至80℃，保温搅拌半小时，趁热过滤。滤液蒸发，在乙醇中结晶，即得粗品。
四、稻壳的深加工
稻壳是稻谷加工成大米时脱出的壳状物，过去主要用作家畜的粗饲料或建筑用的搀和料。占稻谷重量的20％，内含粗纤维30％～45％、木质素21％～26％、蛋白质25％～3％、多缩戊糖16％～22％、灰分7％～9％和水分10％左右。干馏100千克稻壳，可得糠炭35～40千克、糠醛1千克、甲醇02千克、丙酮01千克、杂酚油06千克、醋酸和沥青各14千克及糠煤气26立方米等。用于操作的干馏炉，是一种自然通风式内燃炉。干馏时不需另加燃料，可先将一箩稻壳铺在炉桥上点火燃烧，待火旺后，再倒一层，如此数次，待装至100～125千克后，加盖密封，收集的干馏液量可达稻壳的30％～32％。干馏所得的黑色糠炭经酸、碱处理后，可变成活性炭。干馏液为黄色油状液，静置24小时后，可分成三层：上为轻油层，中为色浅而清的醋酸层，下为黑色油状焦油层。用分液漏斗将三层分离，可分别提取内含的各种有机化合物。
五、酒糟的深加工
酒糟是酒厂发酵后的有机渣，每生产1吨酒大约产生14吨这类废弃物，通常多用做饲料。用现代生物工程方法将其深加工，可制得甲烷和菌丝索蛋白。酒的生产量在世界各国都很大，仅我国淮河流域就有100多家酒厂，其年产酒量约为100多万吨，废渣量达数千万吨，处理效益相当可观。用酒糟厌氧发酵生产甲烷甚为方便，其操作和条件已如前节所述，只要有足够容量的发酵罐及贮罐，这类废渣容易消纳。生产菌丝索蛋白的关键在于筛选合适的真菌。这是一种重要的饲料蛋白。将酒糟即酒厂的发酵釜馏物加入真菌，在合适的pH值下（一般用氢氧化钠溶液调到pH值为40），充分搅拌，加入约26倍量的水，静置12小时，虹吸出上层清液，将下层沉淀离心分离。合并滤液，减压加热脱水，于60℃下干燥，得灰色的粗品。其产量和品质取决于原废渣中蛋白质的含量和性质。释出甲烷及分离蛋白后的残渣仍是一种高效的有机肥。
六、油渣的深加工
在油料和乳制品加工业中要排放许多油渣滤饼，它们有很大的利用潜力。例如，埃及亚历山大城区的食用油精炼中，每年约丢弃5000吨各种油渣，造成严重的环境问题。这些废渣中含有多达5％的残余油，如用碱处理，可以回收70％以上。可用来生产低档肥皂、有漂白能力的活性黏土、纤维素等。奶厂每生产1吨奶酪要产生约7吨高浓度的乳清副产品，其中含有大量乳糖和蛋白质。可先脱水，然后用一种酸介质凝结提取蛋白质，超滤分离；乳糖则通过微生物分解制得。
七、饼粕的深加工
许多饼粕是提取蛋白质的好原料。例如，从花生饼粕中可提取组织蛋白，俗称人造肉；大豆饼粕可制取蛋白肉等。将花生饼粕粉碎，加清水制成含水25％的浆料，加入饼粕量044％的硬脂酸钠-2-乳酸酯和14％的食用油，于120℃下经过挤压机，可得到更具肉组织结构的成品。将大豆饼粕晒干，磨成粉状，取此粉25千克，加入纯碱200克、盐250克和开水11千克，充分搅匀，做成重200克的圆团若干个，依次进入膨爆机，加压加热，使团子熟透，并压延成4厘米×05厘米的带条，干燥，可得175千克成品大豆蛋白肉。此蛋白肉含蛋白质40％以上，其中含有人体必需的氨基酸、微量元素（钙、磷和铁）及维生素等。
八、茶叶的深加工
茶叶是我国特产及主要创外汇商品之一，但我国每年约有10万吨低档茶叶积压库存难以销售，此外还有大量副产品，如茶叶加工过程中产生的茶末、茶树修剪下来的枝叶等。它们都是很有用的资源，进行深加工后可得到许多有价值的物质如茶多酚、咖啡碱、茶色素、单宁、多糖复合体等。这些在食品、医药、日化诸行业中应用广泛，而且提取操作简便、成本低廉、附加值高。其中的茶多酚在低档茶叶和茶末中含量高达20％，主要是儿茶素及其衍生物，将茶叶在较高压力下加热水解即可提取出。茶多酚可作为油脂食品的抗氧化剂，其抗氧化活性远比人工合成的BHT（二丁基羟甲苯）、BHA（丁基羟基茴香醚）、维生素E（α-生育酚）等强。中国农科院茶叶研究所推出的“维多酚”粉剂，用于油脂、火腿、月饼和花生酱等的保鲜，可延长保质期4～5倍。用茶多酚浸泡过的肉类，冷藏后其过氧化物含量比普通方法冷藏的低70％～80％。
九、蚕沙的深加工