男性的外生殖器是暴露在体外的阴囊和阴茎；内生殖器除包在阴囊内的睾丸和附睾外，其余都藏在腹腔下部。
阴囊和睾丸
阴囊位于阴茎后方，肛门前方，表面皱纹很多，呈褐色，在皮肤的下面还有一层很薄的肌肉，肌肉收缩时，阴囊会随之紧缩变小，阴囊内腔分左右两半，两个睾丸分别位于左右两半阴囊腔中。睾丸呈卵圆形，青白色。初生儿的睾丸只有花生米大小；幼童睾丸大小与麻雀卵相近；成年男子的睾丸约有鸽子卵那么大，长3～4厘米，每个重10～15克。一般左侧睾丸比右侧的大一点，也比右侧低一些，睾丸表面有一层光滑的膜，可以在阴囊内自然滑动，故即使在剧烈活动时睾丸也不会受到损伤。睾丸的功能是产生精子和分泌雄性激素。睾丸内的精曲小管是产生精子的场所，分布于精曲小管之间的睾丸间质细胞的功能则是分泌雄性激素。
附睾
附睾形似蝌蚪，贴附在睾丸的上后侧面，一端连着精曲小管，一端与输精管的起始部相接。精子从睾丸排出后暂存在附睾里，继续生长成熟。
输精管
输精管左右各有一条，自附睾起向上，沿着腹股沟，通过腹壁到腹腔里，然后向下曲折到膀胱底部，这时左右两侧的输精管相互接近，和同侧精囊管合并成为射精管，经过前列腺，通到尿道里。在胚胎发育过程中，睾丸原来不在阴囊里，而在腹腔背面，肾脏附近。输精管原是自上而下通进尿道的，后来睾丸逐渐下降，穿过腹壁，才进入阴囊。有的人在出生后睾丸还没有降到阴囊里，仍留在下降的路途上，这就是医学上所称的隐睾症。
精囊
精囊也有两个，似小花生米大小，位于膀胱底部，直肠前方。精囊的功能主要是分泌一种胶状液体。这种液体是精液的成分之一，有利于精子活动。
前列腺
前列腺是一个前后扁平的、呈倒置的栗子形的分泌腺，质硬，底宽大，围在尿道根部，前列腺能分泌一种乳状的前列腺液。射精时，前列腺液、精囊液、附睾和输精管内的精子及尿道球腺的分泌液一起，通过尿道射出体外，这就是射精。所以精液是由精子和精囊、前列腺、尿道球腺的分泌液共同组成的。尿道球腺是两个比黄豆略大的腺体，在尿道上段的两旁，尿道球腺的导管也通向尿道，有润滑尿道作用。