一九四一年一月四日，新四军军部及直属部队九千余人，依照军事委员会指定的路线北移，开到皖南泾县太平间茂林村地区，被顾祝同、上官云相指挥的部队七万余人包围，新四军被迫自卫。至十四日，新四军大部壮烈牺牲，仅千余人突围而去。军长叶挺被俘，项英副军长阵亡，此即历史上震惊中外的“皖南事变”。
一月十五日上午十时半，何应钦召集白崇禧、张治中在总长办公室举行临时会报，研究皖南事变善后办法。军令部对此提出了两个方案：一是明令撤销新四军番号；一是不撤销番号，任其渡江北上，以观其动态如何，再作处置。张治中主张用第二案，白崇禧则主张以甲乙两案呈请蒋介石裁决。蒋介石终于采纳甲案，于一月十七日以国民政府下令宣布新四军为叛军取消新四军番号，并将军长叶挺交付“军法审判”。
一月十八日，中共中央对皖南事变发表谈话，指出皖南事变仅为国民党反动派反共投降大阴谋中之一个步骤而已，全国人民应亟起制止。同时向国民党政府提出惩办皖南事变祸首何应钦、顾祝同、上官云相……
值得注意的是，白崇禧伙同何应钦发出臭名昭彰的“皓”电，为“皖南事变”制造舆论，以后在军委会讨论处置新四军方案时，他一直以强硬派姿态出现。为什么中共中央没有把他列入祸首名单呢？
对于这样一个问题，毛泽东在《关于打退第二次反共高潮的总结》作出了解答，他说：“上次（反共高潮）居于中间立场的桂系，这一次虽然转到反共方面，却和蒋系仍然有矛盾，不可视同一律。”于此可见中共统战手法的巧妙。
因此，由延安派来的刘仲容，依旧在嘉陵新村李子坝八号白公馆工作，他经常与曾家岩五十号八路军重庆办事处保持密切接触。由于刘仲容富有地下工作经验，戴笠统率的军统特务，始终没有抓到他的把柄。
白崇禧在“皖南事变”中让蒋介石充分地利用了一下，事后即冷置一旁，不加理会。白氏深感抑郁，特迁居壁山西温泉别墅。壁山为军训部所在地，部务由次长刘士毅全权负责，所以白崇禧乐得整日与其子女戚属在自建温泉泳池游泳，他此时颇有点息影林泉的味道，几乎忘了江淮河汉之间还有炮火连天的抗日战场。